核心结论：遇到工资表记录为6000元但实际仅发放5000元的情况，您有权要求用人单位补足差额，并可通过协商、投诉或法律途径解决。以下是具体分析：

1. 法律定性：用人单位行为涉嫌违法

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第七条，用人单位必须以货币形式按月支付劳动者工资，且不得克扣或无故拖欠。若工资表记录的金额与实际发放金额不一致，且用人单位无法提供合法依据（如代扣代缴税费、社保等），则构成克扣工资，属于违法行为。

2. 解决步骤：分阶段主张权利

（1）内部协商

• 操作建议：首先与用人单位人事部门或财务部门沟通，要求核对工资表与银行流水，明确差额原因。
• 注意事项：保留工资表、银行流水、劳动合同等证据，协商时建议书面记录（如邮件、微信），避免口头沟通无凭证。

（2）行政投诉

• 投诉渠道：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线或当地人社局官网查询联系方式）。
• 投诉材料：需提交身份证、劳动合同、工资表、银行流水等证据，劳动监察部门将调查并责令用人单位限期支付。

（3）劳动仲裁

• 适用情形：若投诉后仍未解决，可向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 仲裁请求：主张补足工资差额，并可要求支付经济补偿金（如用人单位存在恶意克扣）。
• 时效限制：需在知道或应当知道权利被侵害之日起1年内提出。

3. 证据收集：关键材料清单

• 工资表：需加盖用人单位公章或由负责人签字确认。
• 银行流水：显示实际到账金额，与工资表对比。
• 劳动合同：证明劳动关系及工资标准约定。
• 沟通记录：与用人单位协商的邮件、微信等书面证据。

4. 风险提示：避免常见误区

• 代扣代缴合法性：若差额为社保、公积金、个税等法定代扣项目，用人单位需提供代扣明细，否则仍属违法。
• 时效过期风险：劳动仲裁需在1年内提出，逾期可能丧失胜诉权。
• 自行离职风险：若因克扣工资被迫离职，可主张经济补偿金，但需证明离职原因与克扣工资直接相关。

建议行动：

1. 立即整理工资表、银行流水等证据；
   
2. 优先与用人单位协商，明确差额原因；
   
3. 若协商无果，7日内向劳动监察大队投诉或准备仲裁材料。
   

如有进一步疑问，可直接向我提供具体证据材料，我将协助分析维权方案。