结论前置：在购买合同两份均未保存，且买方违约不买、卖家已同意退回部分预交金但未退完的情况下，卖家可通过协商、发送律师函或提起诉讼的方式追回剩余预交金。

具体分析如下：

1. 协商解决：

   • 尽管合同未保存，但双方之间的交易事实及预交金的存在可通过其他证据（如转账记录、聊天记录、证人证言等）予以证明。
   • 卖家可首先尝试与买方进行友好协商，明确剩余预交金的退还金额、时间及方式，并保留好协商过程中的相关证据（如书面协议、录音等）。

2. 发送律师函：

   • 若协商无果，卖家可委托律师向买方发送律师函，明确指出买方的违约行为及应承担的法律责任，要求买方在规定期限内退还剩余预交金。
   • 律师函具有法律威慑力，有时能够促使买方主动履行退还义务。

3. 提起诉讼：

   • 若买方仍拒绝退还剩余预交金，卖家可向人民法院提起诉讼，要求买方承担违约责任并退还剩余预交金。
   • 在诉讼过程中，卖家需提供充分证据证明交易事实、预交金的存在及买方的违约行为。证据可包括转账记录、聊天记录、证人证言、购买意向书（如有）等。
   • 法院将根据双方提供的证据及法律规定，作出公正判决。若判决买方退还剩余预交金，而买方仍不履行，卖家可申请法院强制执行。

行动建议：

• 卖家应尽快收集并整理相关证据，以便在协商、发送律师函或提起诉讼时能够充分证明自己的主张。
• 在与买方沟通或协商过程中，卖家应保持冷静、理性，避免情绪化行为影响问题的解决。
• 若对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到充分保障，卖家可委托专业律师代为处理相关事宜。