两轮电瓶车租赁纠纷主要由工商行政管理部门管理，同时消费者协会、人民调解委员会、仲裁机构及法院也可根据不同情况介入处理。以下是具体法律依据及处理途径的详细分析：

一、工商行政管理部门

法律依据：

• 根据《合同行政监督管理办法》第五条、第六条及第十八条，经营者不得利用合同从事违法行为，扰乱市场经济秩序。若电瓶车租赁公司存在违规行为，如故意隐瞒与实现合同目的有重大影响的信息，或未以显著方式提请消费者注意合同重要内容，县级以上市场监督管理部门有权责令限期改正，给予警告，并可处十万元以下罚款。

处理途径：

• 当遇到电瓶车租赁纠纷时，可向当地工商行政管理部门投诉。该部门负责市场监督管理和行政执法，有权对租赁公司的违规行为进行调查，并根据相关法律法规进行处罚，以保护消费者权益和维护市场秩序。

二、消费者协会

法律依据：

• 消费者协会作为保护消费者合法权益的社会组织，有权对损害消费者合法权益的行为进行社会监督。

处理途径：

• 若在电瓶车租赁过程中遇到纠纷，可向消费者协会投诉。消费者协会将积极介入调解，促使租赁双方协商解决，从而切实维护消费者的合法权益。

三、人民调解委员会

法律依据：

• 人民调解委员会由基层组织设立，负责调解民间纠纷，具有专业性和公信力。

处理途径：

• 在电瓶车租赁纠纷中，可寻求人民调解委员会的帮助。该委员会可邀请专业法律人士参与调解，充分利用基层资源和力量，促使双方达成和解协议。

四、仲裁机构

法律依据：

• 若租赁合同中存在仲裁条款，则仲裁机构有权根据合同约定进行仲裁，仲裁裁决具有法律效力。

处理途径：

• 当双方在电瓶车租赁合同中约定了仲裁条款时，可向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁机构将根据合同约定和法律规定进行裁决，有效解决纠纷。

五、法院

法律依据：

• 根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律规定，法院有权对民事纠纷进行审理和判决。

处理途径：

• 若以上途径均无法解决电瓶车租赁纠纷，可向有管辖权的法院提起诉讼。法院将根据具体实际情况和合同约定进行审理，并作出公正判决，以维护当事人的合法权益。

建议：在处理电瓶车租赁纠纷时，建议首先尝试与租赁公司协商解决。若协商无果，可根据具体情况选择向消费者协会投诉、向工商行政管理部门举报、寻求人民调解委员会的帮助、申请仲裁或向法院提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。