当被告人在法院翻供时，这是一个涉及法律程序、证据审查以及司法公正的重要问题。以下是对此问题的详细解答：
一、翻供的法律影响
自首与坦白情节的丧失：
- 根据《刑法》第六十七条，犯罪后自动投案并如实供述自己罪行的，是自首，可以从轻或减轻处罚。但若被告人在庭审中翻供，则无法再被认定具备自首情节。
- 同样，若被告人原本因如实供述而获得从轻处罚的机会，翻供后也可能丧失这一情节。
审理程序的转变：
- 在共同犯罪案件中，如果部分被告人否认自身罪行，案件的审理流程可能会从简化程序转变为常规程序，以更全面地审查证据和事实。
信用评价与法律后果：
- 翻供可能影响被告人在法庭上的信用评价，使法官对其诚信产生质疑。
- 无合理理由的翻供不仅可能无法改变案件结果，还可能对被告人产生不利的法律后果，如加重刑罚或影响后续诉讼中的信誉评估。
二、法院的处理原则
全面审查证据：
- 法院在处理翻供案件时，会对全案证据进行全面、客观的审查，不依赖单一供述，而是综合考虑物证、书证、证人证言、鉴定意见等多种证据形式，形成完整的证据链条。
核实翻供真实性：
- 法官会通过询问被告人、证人及组织质证等方式核实翻供的真实性。若翻供无合理理由且与其他证据相矛盾，法院一般不会采信其翻供内容。
依法作出裁判：
- 法院会根据审查核实后的证据和查明的案件事实，依照法律规定作出公正的裁判。若证据足以证明被告人有罪，即使翻供，也会依法定罪量刑；若证据不足，则作出无罪判决。
三、公诉机关与辩护人的角色
公诉机关（检察院）的应对：
- 公诉人应仔细审查被告人提出的翻供理由，包括是否存在非法取证情形，以及新证据的真实性、合法性和关联性。
- 若翻供导致案件事实不清、证据不足，检察院可依法建议法庭延期审理，进行补充侦查，如重新询问证人、收集新物证等，以完善证据体系。
- 公诉人在法庭上应有力质证被告人的翻供，通过出示相关证据指出矛盾之处，并论证翻供内容的不真实性。
辩护人的职责：
- 辩护人需认真听取被告人的翻供原因和依据，为其提供法律帮助。
- 若翻供源于误解或不当诱导，辩护人应在法庭上进行解释和说明。
- 辩护人应严格审查控方证据的合法性，如发现非法取证情形，可申请排除非法证据。
- 根据翻供情况，辩护人应结合案件事实和法律规定提出合理的辩护观点。
四、建议与总结
- 被告人应谨慎对待翻供：翻供是一个需要慎重对待的问题，它可能带来不利的法律后果。被告人应充分认识到这一点，从一开始就如实陈述，以避免不必要的麻烦。
- 各方应依法履行职责：公诉机关、辩护人和法院应依法履行各自的职责，确保案件的公正处理。在处理翻供案件时，应坚持证据裁判原则，不偏不倚地审查证据和事实。
综上所述，当被告人在法院翻供时，法院会结合全案证据进行综合判断，并依法作出公正的裁判。同时，被告人也应充分认识到翻供的法律影响，谨慎对待自己的供述。