针对您提出的小区内自种树如何处理的问题，这通常取决于树木的具体位置以及当地的相关规定。以下是一些详细的建议和步骤，供您参考：
一、确定树木位置
首先，您需要明确这棵树是种植在您个人专有部分（如自家院内）还是小区共有绿地或城镇公共绿地上。这个区分非常重要，因为不同位置的树木处理方式可能截然不同。
二、个人专有部分内的树木处理
评估影响：
- 如果树木已经长大，且对您的居住环境（如通风、采光）或周围邻居造成了明显影响，您可以考虑进行移除或修剪。
了解当地规定：
- 不同地区对于个人专有部分内树木的移除或修剪可能有不同的规定。例如，根据《上海市居住区绿化调整实施办法》，业主栽种于其个人专有部分内的树木，如涉及迁移或砍伐的，无需进行公开征求意见，即可直接办理行政许可手续。
办理行政许可：
- 如果需要移除或修剪树木，您可能需要向当地的绿化管理部门或相关机构申请行政许可。这通常涉及填写申请表、提供树木位置、大小、影响等相关信息，并等待审批。
执行处理：
- 一旦获得许可，您可以按照许可的要求进行树木的移除或修剪。如果可能，您还可以考虑将移除的树木无偿赠送给国家或小区进行再利用。
三、小区共有绿地或城镇公共绿地上的树木处理
遵循管理要求：
- 如果树木种植在小区共有绿地或城镇公共绿地上，您需要遵循相应的管理要求。这通常意味着您不能自行决定移除或修剪树木，而需要与小区物业或当地绿化管理部门协商。
提出申请：
- 如果您认为树木需要移除或修剪，您可以向小区物业或当地绿化管理部门提出申请。申请时，您需要提供充分的理由和证据，以支持您的请求。
等待审批和执行：
- 提交申请后，您需要等待相关部门的审批。一旦获得批准，您可以按照批准的要求进行树木的移除或修剪。
四、其他建议
咨询专业人士：
- 在处理树木问题时，您可以考虑咨询专业的园艺师或绿化工程师。他们可以提供专业的建议和指导，帮助您更好地处理树木问题。
考虑替代方案：
- 如果可能，您可以考虑通过修剪、整形等方式来改善树木对居住环境的影响，而不是直接移除树木。这有助于保持小区的绿化环境，同时解决您的问题。
综上所述，处理小区内自种树的问题需要您根据树木的具体位置和当地的相关规定来采取相应的措施。希望这些建议和步骤能够对您有所帮助。如果您有任何进一步的问题或需要更具体的指导，请随时咨询当地的绿化管理部门或相关机构。