若法院审理后认定出让农用地使用权证的行为违反法律规定，审判结果将根据违法情形、法律后果及当事人诉求等因素综合判定，具体可能包括以下几种情形：

1. 确认行政行为违法并撤销证件
   若出让行为违反《土地管理法》《农村土地承包法》等强制性规定（如未履行法定审批程序、擅自改变土地用途、违反土地利用总体规划等），法院可能依据《行政诉讼法》第七十条，判决确认行政机关颁发使用权证的行为违法，并责令撤销或注销证件。例如，未依法办理农用地转用审批手续即出让土地，法院可认定行政行为程序违法。

2. 判决行政机关重新作出行政行为
   若证件出让程序存在瑕疵（如未公告、未听证等），但土地出让本身符合实体规定，法院可能依据《行政诉讼法》第七十二条，判决行政机关限期重新履行法定程序（如补办审批、重新公示等），而非直接撤销证件。

3. 驳回原告诉求（若出让行为合法）
   若原告主张证件出让违法，但行政机关能证明其已依法履行审批、公示等程序，且土地用途符合规划，法院可能依据《行政诉讼法》第六十九条，判决驳回原告诉求，认定证件出让行为合法有效。

4. 附带赔偿或补救措施
   若证件出让违法导致当事人损失（如土地被非法占用、合同无效等），法院可能依据《国家赔偿法》或《民法典》相关规定，判决行政机关承担赔偿责任，或要求采取补救措施（如恢复土地原状、赔偿经济损失等）。

核心前提与法律依据：

• 农用地使用权出让需严格遵守《土地管理法》第四十四条（农用地转用审批）、第四十五条（征收土地审批）等规定。
  
• 行政行为合法性审查标准包括主体资格、程序合法、实体合规三方面（《行政诉讼法》第六条）。
  
• 法院审判时需平衡公共利益与私人权益，若出让行为涉及国家重大项目或公共利益，可能采取“确认违法但不撤销”的判决方式（《行政诉讼法》第七十四条）。

建议：
若您是案件当事人，需准备以下证据：

1. 土地使用权证及相关审批文件；
   
2. 土地现状照片、规划文件等证明土地用途的证据；
   
3. 行政机关程序违法证据（如未公示、未听证等）；
   
4. 损失证明（如合同、付款凭证等）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。