应提起行政诉讼，而非民事诉讼。具体分析如下：

1. 案件性质决定诉讼类型
   工伤认定属于行政机关的职权范围，社保局对工伤申请的受理或不予受理行为属于具体行政行为。根据《行政诉讼法》第十二条，公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，可提起行政诉讼。因此，若社保局以“超期”为由不予受理，属于行政不作为或行政拒绝行为，应通过行政诉讼解决。

2. 民事诉讼的适用范围
   民事诉讼主要解决平等主体之间的财产或人身关系纠纷，如劳动合同纠纷、侵权赔偿等。但本案中，争议焦点是社保局是否依法履行了行政职责，而非劳动者与用人单位之间的民事权益争议。即使后续涉及工伤赔偿，也需以工伤认定为前提，故民事诉讼无法直接解决行政程序问题。

3. 超期申请的救济路径

   • 行政复议前置：部分地区规定，对社保局不予受理的决定可先申请行政复议，若对复议结果不服再提起行政诉讼。
     
   • 直接提起行政诉讼：若法律未规定复议前置，可直接以社保局为被告，向法院起诉其不予受理行为违法，要求撤销决定并责令受理。
     
   • 证据补充：需注意，若超期非因劳动者过错（如用人单位未及时申报、劳动者因客观原因无法申请等），可在诉讼中提供证据，争取法院认定社保局应受理。

4. 实务建议

   • 尽快启动程序：行政诉讼时效通常为知道或应当知道行政行为之日起6个月内，需注意时效。
     
   • 收集证据：包括工伤事实证据（如医疗记录、证人证言）、超期原因证据（如用人单位拖延证明）、社保局不予受理的书面决定等。
     
   • 同步处理赔偿：若工伤认定最终成立，可另行通过劳动仲裁或民事诉讼主张赔偿，但需以行政程序结果为依据。

总结：针对社保局不予受理工伤申请的行为，应优先通过行政诉讼主张权利，而非民事诉讼。如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询。