公安设卡查车的法律依据主要来源于《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定。以下是对这一法律依据的详细解读：

首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十九条，公安机关交通管理部门有权根据道路和交通流量的具体情况，对机动车、非机动车、行人采取疏导、限制通行、禁止通行等措施。这意味着，在特定情况下，如为了维护交通秩序、保障公共安全或应对突发事件，公安机关交通管理部门可以依法设立检查点，对过往车辆进行检查。

其次，该法第四十条进一步规定，遇有自然灾害、恶劣气象条件或者重大交通事故等严重影响交通安全的情形，采取其他措施难以保证交通安全时，公安机关交通管理部门可以实行交通管制。这同样为公安设卡查车提供了法律依据，特别是在紧急情况下，为了保障交通安全和公共秩序，公安机关有权采取必要的交通管制措施。

此外，虽然直接关于设卡查车的具体条款可能并未在《中华人民共和国道路交通安全法》中明确列出，但该法赋予了公安机关交通管理部门在维护交通秩序和保障公共安全方面的广泛权力。在实际操作中，公安设卡查车往往是为了执行特定的任务，如打击犯罪、查处交通违法行为、保障重大活动安全等，这些任务均属于公安机关的职责范围。

同时，值得注意的是，公安设卡查车必须严格遵守法律法规，确保查车行为的合法性和正当性。未经批准擅自设卡拦截、断路阻断交通等违法行为是受到严格禁止的，一旦发现将依法进行处置。

综上所述，公安设卡查车的法律依据主要来源于《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，这些规定赋予了公安机关交通管理部门在维护交通秩序和保障公共安全方面的权力，同时也要求其严格遵守法律法规，确保查车行为的合法性和正当性。