针对您提出的“施工单位不回复建设单位工程师消息怎么办好”的问题，这确实是一个在工程项目管理中可能遇到的沟通障碍。以下是我为您提供的详细分析和建议：

一、分析不回复消息的可能原因

1. 沟通渠道不畅：施工单位可能未及时查看到工程师的消息，或者消息发送的渠道（如微信、邮件等）并非施工单位常用的沟通方式。
2. 工作繁忙或疏忽：施工单位可能因工作繁忙而暂时忽略了工程师的消息，或者存在疏忽未及时回复。
3. 对消息内容有异议：施工单位可能对工程师提出的某些要求或问题存在异议，因此选择不回复以避免直接冲突。
4. 内部管理问题：施工单位内部可能存在管理混乱，导致消息无法及时传达给相关负责人。

二、解决不回复消息问题的建议

1. 确认沟通渠道：

   • 与施工单位确认最常用的沟通渠道，并确保工程师通过该渠道发送消息。
   • 如果可能，可以要求施工单位提供专门的联系人或对接人，以便更高效地沟通。

2. 明确消息内容和要求：

   • 在发送消息时，尽量明确、具体地描述问题或要求，避免模糊或含糊不清的表述。
   • 可以附上相关的文件、图纸或数据，以便施工单位更准确地理解工程师的意图。

3. 设定回复时限：

   • 在消息中明确设定回复的时限，要求施工单位在规定时间内给予回应。
   • 如果施工单位未按时回复，可以再次发送提醒消息，并抄送相关负责人或上级单位。

4. 采取进一步措施：

   • 如果施工单位长时间不回复且无法联系上，可以考虑通过正式函件或律师函的方式与施工单位沟通。
   • 在极端情况下，如果施工单位的行为严重影响了工程进度或质量，建设单位可以考虑依据合同条款采取相应的法律措施。

5. 借鉴法律案例：

   • 参考类似法律案例（如您提供的内蒙古包头市九原区人民法院审理的建设工程施工合同纠纷案），了解在施工单位不回复消息的情况下，法院如何认定默示意思表示以及相应的法律后果。
   • 这有助于建设单位在采取进一步措施时，有更明确的法律依据和参考。

三、预防措施

1. 加强合同管理：

   • 在签订合同时，明确双方的权利和义务，包括沟通方式、回复时限等条款。
   • 定期对合同执行情况进行检查和评估，确保双方按照合同约定履行义务。

2. 建立有效的沟通机制：

   • 定期组织双方沟通会议，及时解决工程中遇到的问题和困难。
   • 建立项目沟通群或使用项目管理软件，方便双方及时交流和分享信息。

3. 提升施工单位的管理水平：

   • 在选择施工单位时，注重考察其管理水平和沟通能力。
   • 在合作过程中，可以提供必要的培训和支持，帮助施工单位提升管理水平和沟通效率。

综上所述，针对施工单位不回复建设单位工程师消息的问题，建设单位可以通过确认沟通渠道、明确消息内容和要求、设定回复时限、采取进一步措施以及加强合同管理和建立有效的沟通机制等方式来解决。同时，也可以借鉴相关法律案例来增强自身的法律意识和应对能力。