业务员私吞客户回扣二万元，属于违法行为，可能涉及职务侵占或贪污，需根据具体情况处理。以下是具体分析：

1. 法律定性：职务侵占或贪污

• 职务侵占罪：若业务员非国家工作人员（如普通企业员工），利用职务便利将客户回扣非法占为己有，数额较大（通常6万元以上为刑事立案标准，但各地可能不同），可能构成职务侵占罪。2万元虽未达刑事标准，但公司可依据《劳动合同法》解除劳动合同，并要求赔偿损失。
• 贪污罪：若业务员是国家工作人员（如国企员工），利用职务便利侵吞回扣，2万元可能达到贪污罪的刑事立案标准（3万元以上为“数额较大”），需承担刑事责任。

2. 处理步骤

• 内部处理：
  1. 固定证据：收集回扣记录、转账凭证、业务员承认的书面或录音证据。
  2. 公司制度追责：依据公司《员工手册》或《反腐败政策》，解除劳动合同并追偿损失。
  3. 通报批评：内部通报以儆效尤，维护企业合规文化。
• 刑事报案： 若涉嫌贪污或职务侵占（尤其数额接近刑事标准），可向公安机关经侦部门报案，提交证据材料。
• 民事索赔： 通过诉讼要求业务员返还侵占款项，并赔偿公司损失（如客户流失、商誉损害等）。

3. 风险提示

• 证据不足风险：若缺乏直接证据（如业务员否认），可能面临刑事立案困难，需通过审计、客户证言等间接证据补强。
• 合规风险：公司需自查是否存在管理漏洞（如回扣制度不透明），避免被认定为“共同过错”而减轻业务员责任。

4. 建议行动

• 立即止损：暂停业务员职务，防止继续侵占。
• 法律咨询：委托律师分析证据效力，制定报案或诉讼策略。
• 完善制度：修订财务流程，明确回扣处理规则（如上交公司或返还客户），杜绝类似事件。

如有进一步证据或细节需分析，可直接向我提问，我将结合具体案情提供更精准的建议。