公司发现员工只要拿智能手机就处罚，这一行为是否违法，需分情况讨论：
若公司规章制度合法且合理，且处罚与违规行为相称：
- 公司有权根据自身经营管理的需要，制定内部规章制度，包括对员工使用智能手机的规定。如果这些规章制度是依法制定的，且内容合理（例如，为了保障工作安全、提高工作效率或保护公司机密等），同时处罚措施与违规行为相称（例如，首次违规给予警告，多次违规给予更严厉的处罚），那么公司依据这些规章制度对员工进行处罚，通常是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
若公司规章制度不合法或不合理，或处罚与违规行为不相称：
- 如果公司的规章制度违反了法律法规的强制性规定，或者内容不合理（例如，过于苛刻或侵犯员工基本权益），或者处罚措施与违规行为明显不相称（例如，员工仅因携带智能手机就被解雇），那么公司依据这些规章制度对员工进行处罚，可能是违法的。
- 法律后果：员工有权向劳动争议调解组织申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如果对仲裁裁决不服，还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼中，如果法院认定公司的处罚行为违法，可能会判决公司撤销处罚、恢复员工工作或赔偿员工损失等。
建议：
- 公司应确保其规章制度合法、合理，并明确告知员工。在制定或修改规章制度时，应充分听取员工意见，确保规章制度的公平性和合理性。
- 员工应了解并遵守公司的规章制度。如果认为公司的处罚行为违法或不合理，可以通过合法途径维护自己的权益。
总结：公司发现员工只要拿智能手机就处罚是否违法，取决于公司的规章制度是否合法、合理，以及处罚措施是否与违规行为相称。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。