关于第三自然人代收转包项目企业所得税是否合法的问题，需分情况讨论：
若第三自然人代收行为符合税法规定及合同约定：
- 在某些特定情境下，如转包合同中明确约定了由第三自然人代为收取款项，并且该代收行为不违反税法的相关规定（例如，代收款项后及时、足额地缴纳了相应的企业所得税），那么这种代收行为是合法的。
- 合法性的关键在于代收行为是否遵循了税法的规定，包括但不限于税款的申报、缴纳等环节。如果代收人能够按照税法要求，正确计算和缴纳企业所得税，那么该行为就是合法的。
若第三自然人代收行为违反税法规定或合同约定：
- 如果代收行为没有遵循税法的规定，比如未按时申报或缴纳税款，或者代收的款项被用于非法定用途，那么这种代收行为就是违法的。
- 此外，如果转包合同中并未约定由第三自然人代为收取款项，而代收人却擅自进行了代收，这也可能构成违约或违法行为，具体取决于合同条款和法律规定。
法律背景与建议：
- 法律背景：企业所得税的缴纳是企业的法定义务，必须按照税法的规定进行申报和缴纳。任何违反税法规定的行为，都可能面临税务机关的处罚，包括但不限于罚款、滞纳金等。
- 建议：
- 对于转包方而言，应在合同中明确约定款项的收取方式和责任主体，避免出现代收行为引发的法律纠纷。
- 对于代收人而言，应确保代收行为的合法性，包括但不限于按照税法规定申报和缴纳税款，以及遵守合同条款的约定。
- 如果出现代收行为引发的法律问题，建议及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见和帮助。
可能的法律后果：
- 如果第三自然人代收转包项目企业所得税的行为违法，可能面临税务机关的处罚，包括但不限于罚款、滞纳金等。
- 同时，如果代收行为给转包方或其他相关方造成了损失，代收人还可能面临民事赔偿的责任。
综上所述，第三自然人代收转包项目企业所得税是否合法，取决于代收行为是否符合税法的规定以及合同的约定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。