在税收案件中，不予处罚的决定并不必然需要经过重大案件审理程序，这主要取决于案件的具体性质、情节以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、不予处罚的适用情形
不予处罚通常适用于那些情节轻微、危害不大，或者存在法定免责事由的税收违法行为。根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关规定，如果纳税人的违法行为符合不予处罚的条件，税务机关可以依法作出不予处罚的决定。
二、重大案件审理程序的适用
重大案件审理程序通常适用于那些情节严重、影响恶劣或者涉及金额巨大的税收违法案件。这些案件由于涉及面广、社会影响大，因此需要经过更为严格的审理程序，以确保案件的公正处理。然而，并非所有税收案件都需要经过重大案件审理程序，特别是那些情节轻微、符合不予处罚条件的案件。
三、不予处罚与重大案件审理的关系
独立决策：不予处罚的决定是基于案件的具体情节和法律法规的规定作出的，与是否经过重大案件审理程序无直接关联。税务机关在作出不予处罚决定时，会综合考虑案件的违法事实、性质、情节以及社会危害程度等因素。
程序灵活性：对于符合不予处罚条件的税收案件，税务机关可以根据实际情况选择适当的处理程序。如果案件情节轻微，且纳税人能够积极配合税务机关的调查和处理工作，那么税务机关可以依法简化处理程序，快速作出不予处罚的决定。
例外情况：虽然不予处罚的决定通常不需要经过重大案件审理程序，但在某些特殊情况下，如果案件涉及重大税收利益或者存在其他复杂因素，税务机关可能会选择将案件提交给重大案件审理委员会进行审理。然而，这种情况并不常见，且需要符合特定的条件和程序。
四、法律建议
对于纳税人而言，如果面临税收违法行为的指控，应当积极配合税务机关的调查和处理工作，如实提供相关资料和证据。如果认为自己的违法行为情节轻微，符合不予处罚的条件，可以向税务机关提出申请，并说明相关理由和依据。同时，纳税人也可以咨询专业律师，以获取更为详细和准确的法律建议。
如有任何关于税收案件或不予处罚决定的疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和准确的法律解答。