针对您提出的“初步核实阶段辞职怎么办”的问题，这确实是一个涉及纪检监察流程和员工离职管理的重要环节。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在纪检监察机关进行初步核实工作的过程中，如果被核查人提出辞职申请，这一行为并不会直接中断或改变初步核实的程序。初步核实工作有其独立的流程和要求，旨在判明问题的真假、虚实和大小，为后续是否立案提供可靠依据。
一、初步核实阶段的处理原则
继续核实：核查组应继续按照既定程序进行初步核实工作，不受被核查人辞职申请的影响。这包括撰写初步核实情况报告，列明被核查人基本情况、反映的主要问题、办理依据以及初步核实结果、存在疑点、处理建议等。
信息通报：根据一些单位（如南航集团）的管理规定，人力资源部门在收到员工书面辞职申请时，应将这一信息抄送同级纪检监察机构。这有助于纪检监察机构及时了解被核查人的动态，确保初步核实工作的顺利进行。
二、辞职申请的处理
不得办理离职的情形：在初步核实阶段，如果被核查人存在问题线索正在研究处置方式、正在接受谈话函询或初步核实、正在接受纪律审查或监察调查等情形，根据相关规定，不得为其办理离职手续。这是为了防止“逃逸式辞职”，即被核查人试图通过辞职来逃避纪律或法律责任。
离职手续的办理：如果被核查人的辞职申请不符合上述不得办理离职的情形，且初步核实工作未发现其存在严重违纪或违法行为，那么在其按照规定程序提交辞职申请并完成相关手续后，可以办理离职。
三、后续处置建议
综合分析：承办部门（如审查调查部门或监督检查部门）应在核查组形成的情况报告基础上，进一步对初步核实情况进行综合分析，提出处置建议。这包括拟立案审查调查、予以了结、谈话提醒、暂存待查或移送有关党组织处理等方式。
严格报批程序：初步核实情况报告必须履行严格的报批程序，应当报纪检监察机关主要负责人审批，必要时向同级党委主要负责人报告。这是为了确保初步核实工作的严肃性和权威性。
四、特殊情况的处理
如果被核查人在初步核实阶段辞职后，发现其存在严重违纪或违法行为，纪检监察机关仍应依法依规进行追责。这包括通过法律途径追究其责任，或移送有关机关处理。
综上所述，初步核实阶段辞职的处理需要遵循一定的原则和程序。纪检监察机关应继续按照既定程序进行初步核实工作，同时根据被核查人的辞职申请和初步核实结果提出相应的处置建议。在处理过程中，应确保信息的及时通报和严格履行报批程序，以维护纪检监察工作的严肃性和权威性。