针对您提出的“农村自建房承包给乙方后出现严重质量问题应该怎样解决”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、初步处理与证据收集

1. 立即停工并检查： 一旦发现房屋存在严重质量问题，应立即要求乙方停工，并对已完成的工程部分进行详细检查，记录下所有质量问题，包括但不限于结构安全、材料使用、施工工艺等方面的问题。

2. 收集证据：

   • 保留所有与乙方签订的合同、协议、图纸等文件。
   • 拍摄现场照片或视频，记录质量问题的具体情况。
   • 如有必要，可邀请专业机构进行质量鉴定，并出具书面报告。

二、与乙方协商解决

1. 提出整改要求： 根据检查发现的问题，向乙方提出明确的整改要求，包括整改内容、整改期限等。

2. 协商赔偿方案： 如果质量问题导致房屋无法正常使用或需要额外投入进行修复，应与乙方协商赔偿方案，包括修复费用、工期延误赔偿等。

3. 签订书面协议： 如果双方达成一致，应签订书面协议，明确整改内容、赔偿金额、支付方式等条款，以确保双方权益。

三、寻求第三方调解或仲裁

1. 基层调解： 如果与乙方协商无果，可以向基层建筑工程管理单位、人民调解委员会或相关行政主管机关申请调解。这些机构通常具有丰富的调解经验和专业知识，能够帮助双方达成和解。

2. 仲裁机构介入： 如果调解无果，双方可以事后签订书面仲裁协议，请求仲裁机构介入。仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决，裁决结果具有法律效力。

四、法律途径维权

1. 提起诉讼： 如果仲裁结果不满意或乙方拒绝履行仲裁裁决，您可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明乙方的违约行为和给您造成的损失。

2. 法律依据：

   • 根据《民法典》第577条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
   • 如果质量问题严重影响正常居住使用，根据相关司法解释，您还有权请求解除合同和赔偿损失。

五、预防措施与建议

1. 选择可靠施工方： 在选择施工方时，尽量选择自己熟悉、口碑好、经验丰富的施工人来施工。如果找陌生人施工，在签订合同前要注意要求施工方提供尽可能详细的身份信息，并核实其身份。

2. 加强工程监督： 在工程进行期间，要有必要的监督，发现施工方未按合同和图纸施工或施工中存在瑕疵要及时提出并要求施工方修理或返工。

3. 合理支付工程款： 尽量按照工程进度分多笔支付工程款，切勿大笔提前预付。并在完工后扣留一定数额的质量保证金，待质保期满后付清。

综上所述，面对农村自建房承包给乙方后出现的严重质量问题，您应首先收集证据并与乙方协商解决；如协商无果，可寻求第三方调解或仲裁；若仍无法解决，可通过法律途径维权。同时，为预防类似问题再次发生，建议您在选择施工方、加强工程监督和合理支付工程款等方面采取相应措施。