以员工总是请长假为由直接辞退是不合法的，但可以通过合法途径与员工协商一致后辞退。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、法律角度
辞退的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位不能仅以员工请长假为由直接辞退员工。这种辞退行为可能构成违法解除劳动合同，员工有权要求用人单位支付经济补偿金或继续履行劳动合同。
- 只有在员工存在严重违反公司规章制度、严重失职或被依法追究刑事责任等法定情形时，用人单位才能单方面解除劳动合同。
经济补偿：
- 如果用人单位与员工协商一致解除劳动合同，应当按照《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，向员工支付经济补偿。经济补偿的标准根据员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
二、操作角度
了解公司规章制度和劳动合同：
- 在决定辞退请长假的员工之前，用人单位应当全面了解公司的规章制度以及与该员工签订的劳动合同，明确在请长假这一情形下公司的权利和义务。
- 确保辞退行为符合公司规章制度和劳动合同的约定，以及相关法律法规的规定。
与员工进行诚恳沟通：
- 选择一个合适的时间和地点，以尊重和理解的态度与员工进行沟通。可以先对员工过往的工作表现给予一定肯定，然后说明由于其请长假对工作安排等方面造成的影响，以及公司当前面临的实际困难。
- 尝试与员工协商一致解除劳动合同，并明确告知员工将按照法律规定给予相应的经济补偿。
书面通知：
- 将辞退的相关事宜以书面形式正式通知员工，包括辞退的原因、时间、经济补偿的具体情况等内容。
- 确保书面通知的内容准确无误，并由员工签收确认，以避免后续产生纠纷。
三、风险防范角度
避免违法解除：
- 用人单位在辞退请长假的员工时，应当避免违法解除劳动合同的行为。否则，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求用人单位承担违法解除的法律责任。
完善规章制度：
- 用人单位应当完善公司的规章制度，明确请长假的审批程序、期限以及违反规定的处理措施等。这样可以在一定程度上规范员工的请假行为，减少因请长假而引发的纠纷。
保留证据：
- 在与员工沟通、协商以及辞退过程中，用人单位应当保留相关证据，如沟通记录、书面通知、经济补偿支付凭证等。这些证据可以在后续产生纠纷时作为证明用人单位行为合法性的依据。
建议：在处理员工总是请长假的问题时，用人单位应当保持冷静和理性，遵循法律法规的规定和公司规章制度的要求。通过与员工进行诚恳沟通、协商一致解除劳动合同，并按照法律规定给予相应的经济补偿，以减少对员工的伤害和避免给公司带来不必要的法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。