针对您提出的“试用期以同事关系问题为由不合格是否合理”的问题，我们需要从法律框架和实际操作两个层面进行深入分析。

法律框架层面

首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在试用期解除劳动合同，必须满足特定的条件。具体来说，用人单位需要：

1. 明确录用条件：这些条件应与岗位要求直接相关，且必须在员工入职时明确告知。
2. 提供证据：证明员工不符合这些录用条件，这通常包括工作记录、绩效考核等客观证据。
3. 及时沟通：对存在不符合录用条件的员工，需及时将考核结果告知员工，并在试用期满之前明确通知劳动者解除劳动合同。

在您提到的情境中，“同事关系问题”并未直接作为录用条件在劳动合同或相关附件中明确。因此，从法律角度看，仅凭“同事关系问题”作为解除劳动合同的依据，可能缺乏足够的法律支撑。

实际操作层面

从实际操作的角度来看，同事关系虽然对团队氛围和工作效率有重要影响，但它通常不是劳动合同中明确规定的录用条件。除非公司能证明同事关系问题直接影响了员工的工作表现或违反了公司的明确规章制度（如团队合作规定、职场行为准则等），否则仅凭此点解除劳动合同可能面临法律风险。

合理建议

1. 明确录用条件：公司在制定录用条件时，应尽可能具体、量化，并确保与岗位要求直接相关。如果同事关系是公司重视的方面，可以将其纳入录用条件或作为绩效考核的一部分，但需明确其考核标准和权重。
2. 公正考核：在考核过程中，公司应确保考核的公正性和客观性，避免主观臆断。对于同事关系问题的考核，应基于具体事实和证据，而非个人感觉或偏见。
3. 及时沟通：如果公司认为员工在同事关系方面存在问题，应及时与员工沟通，提供改进建议，并给予合理的改进期限。只有在员工未能改进且问题严重影响工作表现时，才考虑解除劳动合同。

综上所述，试用期以同事关系问题为由不合格，在缺乏明确录用条件和客观证据的情况下，可能并不合理。公司应确保解除劳动合同的依据充分、合法，并遵循公正、透明的考核程序。