结论：业主未批复工程量而直接进行结算给分包审计，确实可能存在问题，具体问题取决于工程量确认的流程、合同条款以及相关法律法规的遵循情况。

一、工程量确认与结算流程

在建设工程中，工程量的确认是结算的重要依据。通常，工程量需要经过业主或其代表（如监理单位）的确认后，才能作为结算的依据。如果业主未批复工程量，而分包单位直接进行了结算，并提交给了审计部门，这可能违反了正常的结算流程。

1. 流程违规：正常的结算流程应包括工程量的确认、结算书的编制、审核与批准等环节。如果跳过工程量确认环节，直接进行结算，可能导致结算金额的不准确，甚至引发纠纷。
2. 审计风险：审计部门在审计过程中，如果发现工程量未经业主批复，可能会对结算金额提出质疑，甚至要求重新进行工程量确认和结算。

二、合同条款的约束

建设工程合同中通常会明确工程量的确认方式、结算流程以及违约责任等条款。如果合同中明确规定了工程量需要经过业主批复后才能进行结算，而分包单位未遵守这一规定，那么分包单位可能构成违约。

1. 违约责任：根据合同条款，分包单位可能需要承担因未遵守工程量确认流程而导致的违约责任，如赔偿业主因此遭受的损失。
2. 合同解释：如果合同条款对工程量确认和结算流程的规定不够明确，可能需要通过合同解释来明确双方的权利和义务。在这种情况下，法院或仲裁机构可能会根据行业惯例、交易习惯等因素进行解释。

三、相关法律法规的遵循

在建设工程中，工程量的确认和结算还需要遵循相关法律法规的规定。例如，《建设工程质量管理条例》、《建设工程价款结算暂行办法》等法规都对工程量的确认和结算流程做出了规定。

1. 法规遵循：如果分包单位在未获得业主批复工程量的情况下进行结算，可能违反了相关法律法规的规定，从而面临行政处罚或民事责任。
2. 法律后果：违反法律法规规定的结算行为，可能导致结算无效，甚至引发更严重的法律后果，如被责令重新进行结算、承担违约责任等。

四、建议与措施

针对业主未批复工程量而直接进行结算给分包审计可能存在的问题，建议采取以下措施：

1. 与业主沟通：首先，应与业主进行沟通，明确工程量确认的流程和要求，确保工程量得到业主的批复后再进行结算。
2. 审查合同条款：仔细审查建设工程合同中的相关条款，确保结算行为符合合同约定。如果合同条款存在不明确或争议的地方，应及时与业主协商解决。
3. 遵循法律法规：在结算过程中，应严格遵循相关法律法规的规定，确保结算行为的合法性和有效性。
4. 准备审计材料：在提交结算材料给审计部门时，应确保所有材料真实、完整、准确，并附上工程量确认的相关证据，以减少审计风险。

有问题可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供进一步的法律建议。