结论前置：员工使用个人账户收款而公司不承认的情况，可能涉及民事纠纷、职务侵占或挪用资金等法律问题，需根据具体事实和证据来认定责任。以下是具体分析：

1. 民事纠纷角度：

   • 事实认定：首先需明确员工收款是否属于职务行为，即是否在公司授权范围内或为了公司利益而收款。若员工收款行为与公司业务相关，且公司曾默许或知情，则公司可能需承担相应民事责任。
   • 证据收集：员工应收集能证明收款行为与公司业务相关的证据，如聊天记录、邮件、合同等。公司则需提供反驳证据，证明收款行为与员工个人有关，与公司无关。
   • 法律后果：若法院认定员工收款行为属于职务行为，公司可能需承担还款责任；若认定为员工个人行为，则员工需自行承担还款责任，并可能面临公司追偿。

2. 职务侵占或挪用资金角度：

   • 构成要件：若员工利用职务之便，将公司财物非法占为己有或挪作他用，数额较大，则可能构成职务侵占罪或挪用资金罪。
   • 证据要求：需证明员工存在故意侵占或挪用公司资金的行为，且数额达到刑事立案标准。公司应提供财务记录、银行流水等证据。
   • 法律后果：若构成犯罪，员工将面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。同时，公司有权要求员工返还侵占或挪用的资金。

3. 公司内部管理角度：

   • 规章制度：公司应建立完善的财务管理制度，明确员工收款、报销等流程，避免员工利用个人账户收款。
   • 培训与监督：公司应加强对员工的财务培训，提高员工法律意识，并定期对财务情况进行审计，及时发现并纠正问题。
   • 责任追究：若员工违反公司规章制度，公司有权根据内部规定对员工进行处罚，包括警告、罚款、解雇等。

行动建议：

• 若您作为员工遇到此类问题，建议立即收集相关证据，与公司协商解决；若协商无果，可寻求法律援助或提起民事诉讼。
• 若您作为公司代表处理此类问题，建议先进行内部调查，明确事实真相；若涉及刑事犯罪，应及时向公安机关报案。

如有进一步法律问题，可直接向我咨询。