小三怀孕后被男方殴打，是可以起诉男方的。这一结论主要基于以下法律角度的分析：
一、民事权益角度
身体损害赔偿：
- 若小三因男方的殴打行为导致身体受到损害，如受伤、引发疾病等，她有权基于侵权责任向男方主张赔偿。这包括医疗费、护理费、交通费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。小三需要提供充分的证据，如医疗记录、费用单据、证人证言等，以证明其损害结果与男方行为之间的因果关系。
抚养费支付（如孩子出生）：
- 如果孩子出生且确系男方的子女，小三作为孩子的母亲，有权以孩子的名义起诉男方，要求支付抚养费。非婚生子女与婚生子女享有同等权利，不直接抚养非婚生子女的生父或生母应负担子女的生活费和教育费，直至子女能独立生活为止。但这一权益与殴打行为无直接关联，是在孩子出生后可能涉及的权益。
二、刑事权益角度
故意伤害罪：
- 若男方的殴打行为构成故意伤害罪，即故意非法损害他人身体健康，达到一定的严重程度（如轻伤及以上），小三可以向公安机关报案，依法追究男方的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。
其他可能的刑事犯罪：
- 如果男方的行为还涉及其他违法犯罪行为，如虐待、遗弃等，小三同样可以依法向公安机关报案或向法院提起诉讼，追究相关人员的法律责任。
三、实际操作建议
- 收集证据：小三应尽快收集并保存与殴打行为相关的证据，如医疗记录、费用单据、证人证言、现场照片或视频等。这些证据将对于后续的民事赔偿或刑事追责至关重要。
- 及时报案：如果男方的行为构成犯罪，小三应及时向公安机关报案，以便公安机关及时展开调查并追究相关人员的法律责任。
- 寻求法律帮助：小三可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的诉讼途径。律师将能够提供具体的法律建议和指导，帮助小三更好地维护自己的合法权益。
总结来看，小三怀孕后被男方殴打，不仅有权从民事角度要求男方赔偿身体损害，还有权从刑事角度追究男方的法律责任。在处理此类问题时，小三应综合考虑民事、刑事等多方面的法律规定和实际情况，并寻求专业律师的帮助以更好地维护自己的合法权益。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。