您好，关于设施农用地协议的签订问题，我可以为您详细解答。

设施农用地协议的签订主要涉及以下几个关键步骤和参与方：

1. 经营者申请：

   • 设施农用地的使用者（即经营者）需要向土地权属归属地的农村集体经济组织或村民委员会（以下简称村级组织）提出使用申请。
   • 申请内容应包括项目名称、拟用地位置、拟建设类型、用途、用地面积、生产期限等基本情况。

2. 村级组织审核与公示：

   • 村级组织在收到经营者的申请后，会就用地申请充分征求用地范围内的村民小组和相邻权利人的意见。
   • 协商一致后，村级组织会将用地单位（经营者）、项目名称、地点、用途、生产期限、用地规模、用地补偿、生产建设活动中损毁的土地复垦措施及时限、土地交还和违约责任等情况在村民小组范围内进行公示，公示时间不少于5个工作日。

3. 签订协议：

   • 公示期满无异议的，由村级组织和经营者共同签订用地使用协议。
   • 协议内容应明确双方的权利和义务，包括用地期限、补偿标准、复垦责任等。

4. 特殊情况说明：

   • 对于国有农场的设施农业用地，协议由国有农场主管部门、国有农场和经营者三方共同签订，并由国有农场向县级自然资源主管部门、农业农村主管部门备案。
   • 如果设施农用地涉及使用永久基本农田，还需要经过县级自然资源主管部门的同意，未经同意的，用地不得备案，项目不得动工建设。

5. 备案程序：

   • 用地协议签订后，由村级组织或经营者向乡镇政府申请备案。
   • 乡镇政府会进行一系列的审核工作，包括设施农业建设的必要性和可行性、用地规模是否符合规定等，并提出备案建议。
   • 乡镇自然资源管理部门也会依据农业农村部门的审核建议进行进一步的审核，确保设施农业用地符合政策要求。

综上所述，设施农用地协议主要是由村级组织（或国有农场主管部门、国有农场）和经营者共同签订的。在签订过程中，需要遵循一定的程序和要求，确保协议的合法性和有效性。如果您在签订过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。