征地协议应由具有土地征收权限的市、县人民政府土地行政主管部门与拥有土地所有权的主体签订。以下是对此问题的详细阐述：
一、协议签订主体
主要签订方：
- 根据《土地管理法》及相关法规规定，国家征收土地需依法批准，并由县级以上地方人民政府公告并组织实施。具体征地补偿、安置方案的拟订与实施工作，则由市、县人民政府土地行政主管部门负责。因此，在征地过程中，市、县人民政府土地行政主管部门作为征收主体的代表，负责与土地所有权人签订征地协议。
不同类型土地的签约主体：
- 农村集体土地征收：
- 若土地属于村农民集体所有，应由村集体经济组织或村民委员会作为签约主体。
- 若土地分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有，则由村内各该农村集体经济组织或村民小组负责签订。
- 例如，某县因建设需要征收某村的土地，县自然资源局（土地行政主管部门）会与该村村委会或相关村民小组协商并签订征地协议。
- 国有土地上房屋征收：
- 根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》，市、县级人民政府确定的房屋征收部门负责组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作，并与被征收房屋所有权人签订补偿协议。
- 如某市进行旧城改造，市住建局作为房屋征收部门，会与被征收房屋的所有权人签订国有土地上房屋征收补偿协议。
委托情况：
- 在某些情况下，根据政府的工作安排和部署，乡镇政府或其他相关部门可能会受委托，在授权范围内与被征收人签订征地协议。但这种情况下，也必须得到土地行政主管部门的认可和监督，以确保协议的合法性和有效性。
二、协议签订注意事项
确认双方身份与权限：
- 在签订征地协议前，务必确认签约双方均具备合法的身份和权限。被征收方应核实征收主体的合法性，如查看相关批准文件、公告等；征收主体也应核实被征收方的土地所有权或使用权证明，避免后续产生法律纠纷。
仔细阅读协议内容：
- 征地协议应明确土地补偿费、安置补助费、房屋价值补偿、搬迁费、临时安置费等各项费用的标准、金额、支付方式以及安置途径等关键条款。被征收方在签订协议前，应仔细阅读协议内容，确保自身权益得到充分保障。如有任何疑问或不确定之处，应及时向征收主体或专业律师咨询。
协议签订的合法性与有效性：
- 征地协议的签订必须遵循合法合规的原则。协议内容应符合法律法规要求，双方应签字盖章确认。同时，被征收方有权要求查看相关批准文件，以进一步确认协议的合法性。如发现协议内容存在违法或不合理之处，被征收方有权拒绝签订或要求修改。
三、法律后果与风险提示
法律后果：
- 如征地协议签订不当或存在违法情形，可能导致协议无效或被撤销。这将给双方带来不必要的法律纠纷和经济损失。因此，在签订征地协议时，务必确保协议的合法性和有效性。
风险提示：
- 被征收方在签订征地协议前，应充分了解自己的权益和义务，避免在协议中放弃或损害自己的合法权益。同时，应警惕征收主体可能存在的欺诈、胁迫等行为，确保自己的签字行为是自愿、真实的。
综上所述，征地协议的签订是一项严肃而复杂的法律行为。通过明确签订主体、注意事项以及法律后果与风险提示，可以有效保障被征收人的合法权益，促进征地工作的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。