在配合调查时，如实说明本人违法事实，并不意味着一定要说组织不掌握的内容。以下是对此问题的详细分析：

一、如实说明违法事实的义务

在配合调查的过程中，个人有义务如实说明自己所知的违法事实。这是基于法律对于公民配合调查的基本要求，旨在确保调查的准确性和公正性。如实说明违法事实，不仅是对法律的尊重，也是对自己行为的负责。

二、组织掌握与否并非决定性因素

1. 如实说明的范畴：如实说明违法事实，主要关注的是事实本身的真实性和准确性，而非组织是否已经掌握这些信息。无论组织是否掌握，个人都有义务如实陈述。

2. 组织掌握情况的影响：虽然组织是否掌握某些信息可能影响调查的策略和方向，但这并不改变个人如实说明违法事实的义务。即使组织已经掌握了某些信息，个人仍然需要如实陈述，以避免因隐瞒或歪曲事实而承担法律责任。

三、可能面临的法律后果

1. 如实陈述的益处：如实说明违法事实，有助于调查机关准确查明案件事实，依法作出公正处理。对于个人而言，如实陈述可能有助于减轻或免除法律责任，尤其是在主动配合调查、认罪态度良好的情况下。

2. 隐瞒或歪曲事实的后果：如果个人在配合调查时隐瞒或歪曲违法事实，可能构成妨碍公务、伪造证据等违法行为，从而面临更严重的法律后果。这包括但不限于罚款、拘留甚至刑事责任。

四、建议与注意事项

1. 保持诚实态度：在配合调查时，个人应始终保持诚实态度，如实说明自己所知的违法事实。不要试图隐瞒或歪曲事实，以免承担不必要的法律责任。

2. 了解法律后果：在配合调查前，个人应了解相关法律后果，明确自己的权利和义务。这有助于个人在调查过程中保持冷静和理性，避免因情绪化或无知而做出错误决策。

3. 寻求法律帮助：如果个人在配合调查过程中遇到法律问题或困惑，可以及时寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询和辩护服务，帮助个人维护自己的合法权益。

如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。