针对您提出的“非法行医公安立案后会怎么样处理”的问题，我将从司法机关的处理流程、嫌疑人可能面临的法律后果，以及受害者权益的保障三个方面，为您进行详细解答。
一、司法机关的处理流程
侦查阶段： 公安立案后，会立即展开侦查工作，收集与非法行医相关的证据，包括但不限于就诊记录、收费凭证、证人证言、现场勘查笔录等。这些证据将用于证明犯罪嫌疑人的非法行医行为及其造成的后果。
审查起诉阶段： 侦查终结后，若认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，公安机关会将案件移送检察院审查起诉。检察院会对案件进行全面审查，包括证据的合法性、关联性和充分性，以及犯罪嫌疑人的主观故意和客观行为等。若检察院决定提起公诉，会向法院提交起诉书及相关证据材料。
审判阶段： 法院收到起诉书后，会安排开庭审理。在庭审过程中，法院会听取控辩双方的意见，审查证据，认定事实，并根据法律规定作出判决。若认定构成非法行医罪，法院会依法判处相应的刑罚，包括有期徒刑、拘役，并处罚金等。
二、嫌疑人可能面临的法律后果
根据《刑法》第336条的规定，未取得医生执业资格非法行医，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或单处罚金。若严重损害就诊人身体健康，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。
此外，除了刑事处罚外，嫌疑人还可能面临行政处罚。根据《基本医疗卫生与健康促进法》等相关法律法规的规定，卫生健康行政部门可以对非法行医者没收违法所得及药品、器械，并处以罚款等。
三、受害者权益的保障
刑事附带民事诉讼： 在刑事诉讼过程中，受害者可以通过附带民事诉讼的方式，要求非法行医者赔偿物质损失，如医疗费、误工费等。法院在判决时，会一并考虑民事赔偿部分，确保受害者的合法权益得到保障。
另行提起民事诉讼： 除了刑事附带民事诉讼外，受害者还可以另行提起民事诉讼，要求非法行医者承担更全面的民事赔偿责任。赔偿范围包括医疗费、误工费、护理费、残疾生活辅助具费、残疾赔偿金等为治疗和康复支出的合理费用。若造成死亡，还需赔偿丧葬费和死亡赔偿金。
关注案件进展，配合调查： 受害者在案件处理过程中，应关注案件进展，积极配合司法机关的调查工作，提供必要的证据和信息。这有助于司法机关更准确地认定事实，确保对非法行医者的定罪量刑合理公正。
综上所述，非法行医公安立案后，司法机关会按照法定程序进行处理，包括侦查、审查起诉和审判等阶段。嫌疑人可能面临刑事处罚和行政处罚，而受害者则可以通过刑事附带民事诉讼或另行提起民事诉讼的方式，要求赔偿物质损失和精神损害。希望这些解答能够帮助您更好地了解非法行医立案后的处理流程和相关法律后果。