在符合法定程序和合同约定的前提下，变更总包单位后工程可以继续施工。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法定程序角度

• 变更合法性：根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，总包单位的变更需经过建设单位同意，并依法办理相关变更手续。若变更程序合法，新总包单位承接工程后，工程可继续施工。
• 资质要求：新总包单位必须具备相应的施工资质，且资质等级需符合工程要求。若新单位资质不符，则不得继续施工，否则可能面临行政处罚。

2. 合同约定角度

• 原合同处理：若原总包合同中有关于变更总包单位的条款，需按合同约定执行。例如，合同可能约定变更需经双方协商一致，或约定变更后的权利义务承接方式。
• 新合同签订：变更总包单位后，建设单位与新总包单位需签订新的施工合同，明确双方权利义务。新合同生效后，工程可按新合同约定继续施工。

3. 实际施工角度

• 施工连续性：若变更总包单位不影响施工进度和工程质量，且新总包单位能迅速接手工程，则工程可继续施工。但需注意，变更过程中可能因交接问题导致短暂停工。
• 责任划分：变更总包单位后，需明确原总包单位与新总包单位在工程质量、安全等方面的责任划分，避免因责任不清导致纠纷。

4. 可能风险及建议

• 风险点：变更总包单位可能引发工期延误、质量纠纷、农民工工资支付等问题。若处理不当，可能影响工程整体进度和效益。
• 建议措施：
  1. 提前规划：建设单位在变更总包单位前，应充分评估变更的必要性、可行性及风险，制定详细变更方案。
  2. 依法办理：严格按照法定程序办理变更手续，确保变更合法有效。
  3. 签订新合同：与新总包单位签订书面合同，明确双方权利义务，特别是关于工期、质量、安全、付款等条款。
  4. 加强监管：变更后，建设单位应加强对新总包单位的监管，确保其按合同约定施工，及时解决施工中出现的问题。

5. 特殊情况处理

• 紧急情况：若因原总包单位违约、破产等原因需紧急变更总包单位，建设单位可依法采取紧急措施，如临时指定新总包单位，但需后续补办相关手续。
• 政府干预：若工程涉及公共利益或重大安全，政府可能介入变更过程，此时需遵循政府指导，确保工程顺利推进。

总结：变更总包单位后工程能否继续施工，取决于变更程序是否合法、合同约定是否明确、新总包单位资质是否符合要求以及实际施工条件是否允许。建议您在变更前充分评估风险，依法办理变更手续，并与新总包单位签订详细合同，确保工程顺利推进。如有具体法律问题，可直接向我咨询。