劳动者因不能胜任工作被辞退时，用人单位需支付经济补偿，若未履行法定程序则构成违法解除，需支付赔偿金。具体分析如下：

一、合法辞退与经济补偿

1. 法定程序：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，当劳动者不能胜任工作时，用人单位应先对其进行培训或调整工作岗位。若经培训或调岗后，劳动者仍不能胜任工作，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人，或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。

2. 经济补偿标准：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。

计算公式：

• 经济补偿 = 工作年限 × 月工资（工作年限满一年按一个月计算，六个月以上不满一年按一年计算，不满六个月按半个月计算）
• 若月工资高于本地区上年度职工月平均工资三倍，则经济补偿 = 工作年限 × （本地区上年度职工月平均工资 × 3），且支付年限最高不超过十二年。

二、违法辞退与赔偿金

1. 违法情形：若用人单位未履行法定程序，如未经培训或调岗就直接以不能胜任工作为由辞退劳动者，可能构成违法解除劳动合同。

2. 赔偿金标准：在违法解除的情况下，用人单位需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

计算公式：

• 赔偿金 = 经济补偿 × 2
• 例如，若劳动者工作3年5个月，正常经济补偿是3.5个月工资，违法辞退则要支付7个月工资作为赔偿金。

三、建议与注意事项

1. 用人单位建议：用人单位应严格遵守法定程序，先对不能胜任工作的劳动者进行培训或调岗，再决定是否解除劳动合同。同时，应保留好相关证据，如培训记录、调岗通知、考核记录等，以备不时之需。

2. 劳动者建议：若劳动者遇到单位违法解除的情况，应保留好相关证据，如辞退通知、工资单、工作记录等，通过合法途径维护自身权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼。

3. 社保与档案处理：被辞退后，劳动者还应关注社保和档案的处理问题。一般公司有义务协助员工办理社保减员和档案转移手续。若公司未履行相关义务，劳动者可向相关部门投诉或寻求法律帮助。

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