有烟草证但运输烟草价值超过5万元，若构成非法经营罪或走私罪，则可能面临刑事处罚，具体量刑需根据案件实际情况判定。以下是对此问题的详细分析：

一、非法经营罪的量刑标准

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条，违反国家规定，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品（如烟草），扰乱市场秩序，情节严重的，将处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，将处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

2. 情节认定：

   • 依据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理非法生产、销售烟草专卖品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，非法经营烟草专卖品，若非法经营数额在五万元以上，或违法所得数额在二万元以上，即认定为“情节严重”。
   • 若非法经营数额在二十五万元以上，或违法所得数额在十万元以上，则认定为“情节特别严重”。

3. 量刑建议：

   • 若您的行为被认定为“情节严重”，则可能面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
   • 若被认定为“情节特别严重”，则可能面临五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

二、走私罪的量刑标准（如涉及走私）

1. 法律依据：

   • 根据《最高人民法院关于审理走私刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，走私普通货物、物品（包括烟草），偷逃应缴税额在五万元以上不满十五万元的，属于“情节较轻”的走私行为；偷逃应缴税额在十五万元以上的，则属于“情节严重”的走私行为。

2. 量刑建议：

   • 对于“情节较轻”的走私行为，将依法追究相应的刑事责任，但量刑相对较轻。
   • 对于“情节严重”的走私行为，将面临更为严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。

三、量刑的综合考量因素

1. 犯罪情节：包括运输烟草的具体数量、价值、运输方式、是否初犯等。
2. 主观故意：行为人是否明知而为之，以及主观恶性的大小。
3. 社会危害后果：行为对市场秩序、国家税收等造成的损害程度。
4. 从轻、减轻处罚情节：如自首、立功、如实供述等。

四、建议与提示

1. 核实许可情况：首先确认您是否持有合法的烟草专卖零售许可证等相关许可，以及运输行为是否在许可范围内。
2. 咨询专业律师：由于案件具体情况可能复杂多变，建议您直接向我咨询，以便更准确地评估法律风险。
3. 配合调查：如面临调查或诉讼，应积极配合相关部门的工作，如实陈述事实，争取从轻或减轻处罚。

总结来说，有烟草证但运输烟草价值超过5万元，若构成非法经营罪或走私罪，则可能面临刑事处罚。具体量刑需根据案件实际情况，结合犯罪情节、主观故意、社会危害后果等多方面因素综合判定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。