分包单位是否需要退还农民工保证金，需结合具体情况判断，核心结论如下：

1. 若分包单位已按合同约定完成施工且无欠薪等违规行为：
   根据《保障农民工工资支付条例》及相关地方规定，分包单位在工程竣工验收合格、农民工工资全部结清且无劳动纠纷的情况下，有权申请退还已缴纳的农民工工资保证金。退还流程通常需提交竣工验收报告、工资结清证明等材料，经总承包单位、建设单位及劳动监察部门审核后办理。

2. 若分包单位存在欠薪、未结清工资或违反劳动法规的情形：
   劳动监察部门或建设行政主管部门有权暂扣或不予退还保证金，并要求分包单位限期整改。若逾期未整改或整改不到位，保证金可能被用于支付农民工工资，剩余部分（如有）方可退还。

3. 若保证金缴纳主体为总承包单位，分包单位未直接缴纳：
   实践中，农民工工资保证金通常由总承包单位统一缴纳，分包单位不直接涉及退还问题。但若分包单位与总承包单位约定由分包方承担保证金，则需按内部协议处理退还事宜，此时需核查合同条款及资金流向。

建议行动：

• 核查当地具体政策（如省级《保障农民工工资支付工作实施办法》），不同地区对保证金缴纳比例、退还条件的规定可能存在差异；
  
• 保留工程竣工验收文件、工资发放记录等证据，以便申请退还时提交；
  
• 若遇退还纠纷，可向劳动监察部门投诉或通过法律途径主张权利。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的处理方案。