同居12年怀孕流产且男方出轨的情况下，能否起诉对方需分情况讨论，具体分析如下：
一、若流产与男方过错行为存在因果关系，可考虑起诉
侵权责任角度：
- 若男方存在暴力行为、强迫性行为等过错，导致女方流产，女方可依据《民法典》中关于侵权责任的规定，要求男方承担民事赔偿责任。赔偿范围可能包括医疗费、误工费、护理费、营养费等因流产产生的合理费用。
- 证据要求：女方需提供医疗记录、证人证言等证据，以证明流产与男方的过错行为之间存在因果关系。例如，医院诊断证明、病历记录男方暴力行为的证人证言等。
违约责任角度：
- 若双方曾有关于生育等相关约定，男方违反约定导致女方最终流产，女方可基于约定要求其承担违约责任。
- 证据要求：女方需提供证明双方约定及男方违约的证据，如书面协议、聊天记录等。
二、若流产与男方过错行为无因果关系，起诉难度较大
自身原因导致流产：
- 若流产是由于女方自身的原因导致，如女方自身疾病、意外事故等，那么女方通常无法起诉男方要求其承担侵权责任或违约责任。
出轨行为本身：
- 男方出轨行为虽违背道德，但一般不直接构成对女方流产的侵权或违约。除非出轨行为与流产存在直接因果关系（如出轨导致的精神刺激等间接因素，但此情况下证明因果关系难度较大），否则难以仅凭出轨行为起诉男方要求赔偿流产损失。
三、同居关系下的特殊考量
同居关系与婚姻关系的区别：
- 同居关系不受法律特别保护，与婚姻关系在法律上存在显著差异。因此，在同居关系下，女方起诉男方的法律基础相对薄弱。
建议采取的措施：
- 收集证据：无论选择何种途径维权，收集证据都是关键。女方应尽可能保留与流产、男方过错行为相关的所有证据。
- 协商解决：在起诉前，可尝试与男方协商解决，看是否能达成赔偿协议。
- 法律咨询：在采取任何行动前，建议女方咨询专业律师（即我），以获取更具体的法律建议。
举例说明：假设女方小张与男方小李同居多年后怀孕，后因小李的暴力行为导致流产。小张可收集医院诊断证明、病历记录小李暴力行为的证人证言等证据，起诉小李要求其承担医疗费、误工费等赔偿责任。若小张无法证明流产与小李的暴力行为存在因果关系，则起诉难度较大。
总结与建议：同居12年怀孕流产且男方出轨的情况下，能否起诉对方取决于流产与男方过错行为之间是否存在因果关系。若存在因果关系，女方可考虑起诉要求赔偿；若不存在因果关系，起诉难度较大。建议女方在采取任何行动前咨询专业律师（即我），以获取更具体的法律建议。