政府投资项目中政府收取征地协调费是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法情形
法律法规明确规定：
- 如果地方性法规、规章或政府规范性文件明确规定了政府在征地过程中可以收取征地协调费，并且该费用用于合理的征地协调工作（如解决征地过程中的纠纷、协调各方利益等），同时收费标准、程序等均符合法律法规的要求，那么这种收费是合法的。
- 例如，某些地区可能为了平衡征地双方利益，促进征地工作顺利进行，通过地方立法或政府规章的形式，规定了征地协调费的收取标准和用途。
合同或协议约定：
- 在政府投资项目中，如果政府与被征地方或相关方通过合同或协议的形式，明确约定了征地协调费的收取和支付方式，且该合同或协议不违反法律法规的强制性规定，那么这种收费也是合法的。
- 这种情况下，征地协调费可以视为合同双方自愿达成的协议内容，受法律保护。
非法情形
无法律法规依据：
- 如果政府在没有法律法规明确规定的情况下，擅自收取征地协调费，且该费用没有合理的用途或收费标准不透明，那么这种收费就是非法的。
- 这种情况下，被征地方或相关方有权拒绝支付，并可以向有关部门投诉或寻求法律救济。
违反法律法规强制性规定：
- 即使政府有收取征地协调费的意愿，但如果收费标准、程序等违反了法律法规的强制性规定（如超出了法定收费范围、未按照法定程序进行收费等），那么这种收费也是非法的。
- 这种情况下，政府不仅可能面临被征地方或相关方的法律挑战，还可能受到行政处罚或纪律处分。
法律建议
- 核实收费依据：在面对政府收取征地协调费时，被征地方或相关方应首先核实该收费是否有法律法规依据，以及收费标准、程序等是否符合法律法规的要求。
- 保留相关证据：如果认为政府收取的征地协调费不合法，被征地方或相关方应保留好相关证据（如收费通知、缴费凭证等），以便在需要时进行维权。
- 寻求法律救济：如果政府收取的征地协调费确实不合法，被征地方或相关方可以通过行政复议、行政诉讼等法律途径进行维权，要求政府退还非法收取的费用，并可能获得相应的赔偿。
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