在集体土地房屋征收时，被征收人通常不能单方委托评估公司进行评估。以下是对此问题的详细分析：

一、委托评估的主体

在集体土地房屋征收过程中，评估土地及房屋价值的权力通常由市、县级人民政府或其确定的房屋征收部门行使。这些部门负责组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作，包括委托具有相应资质的房地产价格评估机构进行价值评估。这一规定确保了评估工作的权威性和公正性，避免了因单方委托可能带来的不公和偏见。

二、被征收人的参与权

虽然被征收人不能单方委托评估公司，但他们在评估机构的选定过程中享有参与权。法规明确规定，房地产价格评估机构应由被征收人协商选定。如果被征收人协商不成，则通过多数决定、随机选定（如投票、摇号等方式）来确定评估机构。这一制度设计旨在保障被征收人的合法权益，确保评估机构能够相对中立、客观地开展评估工作。

三、单方委托评估的潜在问题

1. 公正性受质疑：单方委托评估可能导致评估结果受到委托方的影响，从而损害另一方的利益。在集体土地房屋征收中，这可能导致被征收人获得的补偿低于其实际应得的数额。
2. 法律风险：单方委托评估可能违反相关法律法规的规定，导致评估结果无效或被撤销。这不仅会浪费时间和资源，还可能给委托方带来法律风险。

四、建议与注意事项

1. 遵循法定程序：在集体土地房屋征收过程中，被征收人应遵循法定程序，参与评估机构的选定过程，确保评估的公正性和独立性。
2. 了解评估标准：被征收人应了解评估机构所采用的评估标准和方法，以便对评估结果进行合理的质疑和申诉。
3. 寻求法律援助：如果被征收人对评估结果有异议或认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

总结来看，在集体土地房屋征收时，被征收人不能单方委托评估公司进行评估。他们应遵循法定程序，参与评估机构的选定过程，并了解评估标准和方法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。