结论：农村集体所有土地合同期限设定为6年是否合规，需结合土地用途及法律规定综合判断，存在合规与不合规两种情形。具体分析如下：

1. 若土地用途为耕地承包，6年期限可能不合规
   根据《农村土地承包法》第二十一条，耕地的承包期为三十年。若合同将耕地承包期限约定为6年，明显短于法定最低期限，属于违法调整承包期，可能面临合同无效或需延长至法定期限的法律后果。

2. 若土地用途为草地或林地承包，6年期限可能合规但需谨慎
   《农村土地承包法》规定，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年。若合同将草地或林地承包期限约定为6年，虽未直接违反法律强制性规定，但可能因期限过短导致承包方无法充分行使经营权（如林木生长周期较长），实践中需结合具体用途评估合理性。

3. 若土地用途为非承包经营性用地（如租赁、合作开发），6年期限可能合规
   对于农村集体建设用地使用权出租、入股等非承包经营行为，法律未规定统一期限，但需符合《民法典》第七百零五条关于租赁期限不得超过二十年的限制。若合同期限为6年，未超过该上限，且经集体经济组织成员会议三分之二以上成员同意，程序合法，则期限约定有效。

实务建议：

• 签订合同前，务必明确土地用途（承包/非承包），并核查当地政策是否对期限有额外限制（如部分省份对集体经营性建设用地出租期限有细化规定）。
  
• 若涉及承包地调整，需严格履行法定程序（如民主议定、报乡镇政府批准），避免因程序违法导致合同无效。
  
• 合同中应明确约定“期限届满后优先续约”等条款，降低经营风险。
  

如有具体合同文本或土地用途细节，可进一步提供信息，我将为您分析条款合法性及风险点。