在损害幼苗案件中，若主责任人已赔付给农户并得到了谅解，其判刑情况需结合具体案情及法律规定综合判断，无法直接给出确定的刑期，但可以分析影响判刑的主要因素。
一、影响判刑的主要因素
犯罪情节：
- 损害幼苗的数量、价值以及造成的实际损失是判断犯罪情节轻重的重要依据。若损害的幼苗数量巨大、价值高昂，或造成了严重的经济损失，则犯罪情节相对严重，可能面临较重的刑罚。
- 犯罪手段、动机等也会影响判刑。例如，若采用特别恶劣的手段进行破坏，或出于恶意报复等动机，可能加重刑罚。
认罪态度与悔罪表现：
- 主责任人是否主动投案自首、如实供述犯罪事实，以及在案件处理过程中的态度，如是否积极配合调查、是否真诚悔罪等，都会影响判刑。
- 已赔付给农户并得到谅解，表明主责任人有一定的悔罪表现，这通常会在量刑时予以考虑，可能减轻刑罚。
法律规定：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，故意毁坏财物罪（包括损害幼苗）的刑罚幅度取决于犯罪情节的严重程度。一般而言，数额较大或者有其他严重情节的，处三年以下有期徒刑、拘役或者罚金；数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上七年以下有期徒刑。
二、可能的判刑情况
若犯罪情节较轻：
- 如损害的幼苗数量较少、价值较低，且主责任人认罪态度好、积极赔付并得到谅解，可能面临较轻的刑罚，如拘役、罚金或短期有期徒刑，并可能适用缓刑。
若犯罪情节较重：
- 如损害的幼苗数量巨大、价值高昂，或造成严重经济损失，且主责任人虽有赔付和谅解情节，但犯罪手段恶劣、动机卑劣等，可能面临较重的刑罚，如三年以上七年以下有期徒刑。
三、法律建议
积极配合调查：
- 主责任人应积极配合司法机关的调查工作，如实供述犯罪事实，以体现其认罪态度和悔罪表现。
继续履行赔付义务：
- 尽管已赔付给农户并得到谅解，但主责任人仍应确保赔付义务的全面履行，以进一步体现其悔罪诚意。
寻求专业法律帮助：
- 在案件处理过程中，主责任人应寻求专业律师的法律帮助，以更好地维护自己的合法权益，并争取从轻或减轻处罚。
若您或他人面临类似情况，建议直接向我咨询，我将根据具体案情提供详细的法律分析和建议。