民办学校超范围经营并不影响其主体资格，且在超范围经营的情况下，仍然可以确认劳动关系。以下从不同角度进行详细分析：

一、民办学校超范围经营对其主体资格的影响

1. 主体资格的独立性：民办学校的主体资格是由其依法设立并登记注册所确定的，与其经营范围无直接关联。超范围经营是指民办学校从事了其登记注册范围之外的业务活动，但这并不改变其作为独立法人的主体资格。
2. 法律责任：虽然超范围经营可能违反相关行政法规，面临行政处罚等法律责任，但这并不直接导致其主体资格的丧失。行政处罚通常针对的是违法行为本身，而非对主体资格的否定。

二、超范围经营下劳动关系的确认

1. 劳动关系的本质：劳动关系是指劳动者与用人单位之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。其确认主要依据的是劳动者是否为用人单位提供了劳动，以及用人单位是否向劳动者支付了劳动报酬等事实，而非用人单位是否超范围经营。
2. 法律适用：在确认劳动关系时，应适用《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规。这些法律法规并未将用人单位的经营范围作为确认劳动关系的必要条件。因此，即使民办学校超范围经营，只要其与劳动者之间存在实际的劳动关系，就可以依法确认。
3. 实践操作：在实际操作中，如果劳动者与民办学校之间存在劳动关系争议，劳动者可以通过向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼等方式来维护自己的合法权益。在仲裁或诉讼过程中，仲裁机构或法院将依据相关法律法规和事实证据来确认双方是否存在劳动关系，而不会因为民办学校超范围经营就否定其劳动关系的存在。

三、建议与风险提示

1. 合规经营：民办学校应严格遵守相关法律法规，确保在其登记注册范围内开展业务活动，避免超范围经营带来的法律风险。
2. 完善劳动合同：民办学校在与劳动者建立劳动关系时，应依法签订书面劳动合同，明确双方的权利义务关系，以减少劳动争议的发生。
3. 及时咨询与处理：如果民办学校或劳动者在劳动关系方面遇到问题或争议，应及时咨询专业律师或相关机构，以便及时、有效地解决问题。

总结来看，民办学校超范围经营并不影响其主体资格，且在超范围经营的情况下，仍然可以确认劳动关系。但为了避免不必要的法律风险，民办学校应严格遵守相关法律法规，确保合规经营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。