核心前提：用户咨询的是在合同履行期限届满后，实际履行行为超出原合同约定时间的情况下，如何进行费用结算的法律问题。
结论前置：
- 合同有明确约定时：若合同中已对超期履行的费用计算方式作出明确规定（如日违约金比例、超期服务单价等），则应优先按合同约定执行。例如，建设工程施工合同中约定“逾期竣工的，按每日合同价款的0.1%支付违约金”，则发包方有权按此标准主张费用。
- 合同无约定或约定不明时：需根据实际履行情况、行业惯例及公平原则综合判定：
- 继续履行型超期：若超期履行仍属原合同义务的延续（如设备租赁合同到期后继续使用），可参照原合同单价结算，但需注意是否构成事实合同关系。
- 新增服务型超期：若超期履行涉及新增服务内容（如原设计合同到期后增加修改服务），应按实际提供的服务内容协商定价，或参照市场同类服务价格结算。
- 违约赔偿型超期：若超期系因一方违约导致（如卖方延迟交货），守约方有权主张实际损失赔偿，包括直接损失（如另行采购的差价）和可得利益损失（如预期利润），但需以可预见性为限。
法律分析：
- 合同解释原则：根据《民法典》第142条，有相对人的意思表示解释，应当按照所使用的词句，结合相关条款、行为的性质和目的、习惯以及诚信原则，确定意思表示的含义。若合同条款存在歧义，应倾向于保护相对弱势方的利益。
- 实际履行原则：根据《民法典》第509条，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。超期履行虽超出原期限，但若双方未解除合同且实际履行，可视为对原合同的变更或延续，需根据履行情况调整费用。
- 损失赔偿范围：根据《民法典》第584条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。
实务建议：
- 审查合同条款：首先核对合同中关于履行期限、费用结算、违约责任的约定，明确双方权利义务。
- 固定证据：保存超期履行期间的沟通记录、工作成果、费用支出凭证等，以证明实际履行情况。
- 协商优先：建议双方先通过协商确定费用，可参考市场价格、行业惯例或第三方评估结果。
- 诉讼准备：若协商不成，需准备起诉材料，包括合同文本、履行证据、损失计算依据等，并注意诉讼时效（一般为3年）。
风险提示：超期履行可能涉及合同变更、违约责任、诉讼时效等多重法律风险，建议根据具体情况制定应对策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询。