结论：在以借款起诉对方后，若对方抗辩为投资款，一般情况下，您不能再以投资款为由进行起诉，但具体还需根据案件实际情况和证据情况来判断。

分析：

1. 诉讼标的与请求权基础：

   • 借款纠纷与投资纠纷是两种不同的法律关系，其请求权基础和法律构成要件均不相同。借款纠纷主要基于借贷合同关系，要求返还借款本金及利息；而投资纠纷则可能涉及合伙、投资协议等法律关系，要求分配利润或承担亏损。
   • 若您已选择以借款纠纷为由提起诉讼，并经过法院审理，那么该诉讼的标的和请求权基础已经确定。在此情况下，若对方抗辩为投资款，且法院未采纳您的借款主张，您通常不能再次以投资款为由提起诉讼，因为这可能构成重复起诉，违反“一事不再理”原则。

2. 证据与事实认定：

   • 在诉讼过程中，证据的收集和事实的认定至关重要。若您能提供充分证据证明双方之间存在借贷关系，而非投资关系，那么即使对方抗辩为投资款，法院也可能支持您的借款主张。
   • 反之，若您无法提供充分证据证明借贷关系，且对方提供的证据足以证明双方之间存在投资关系，那么法院可能驳回您的借款主张。在此情况下，您若想以投资款为由主张权利，需要另行提起诉讼，但需注意避免重复起诉的问题。

3. 法律程序与策略：

   • 在诉讼过程中，若发现对方抗辩为投资款，且您认为该抗辩可能成立，您可以考虑在诉讼中变更诉讼请求或提出反诉，将投资纠纷纳入同一诉讼程序中解决。但需注意，这需要符合法律规定的程序要求，并经过法院同意。
   • 若您决定在借款纠纷诉讼结束后，再以投资款为由提起诉讼，您需要确保新的诉讼请求与之前的借款纠纷诉讼请求不重复，且存在新的法律事实和证据支持。否则，可能面临被法院驳回起诉的风险。

建议：

• 在提起诉讼前，务必充分收集证据，明确双方之间的法律关系和请求权基础，以避免因法律关系认定不清而导致的诉讼风险。
• 若在诉讼过程中发现对方抗辩可能成立，且您认为有必要将投资纠纷纳入诉讼程序解决，可以考虑与对方协商或向法院申请变更诉讼请求、提出反诉等。
• 若您决定在借款纠纷诉讼结束后，再以投资款为由提起诉讼，请务必咨询专业律师，确保新的诉讼请求合法、有效，并避免重复起诉的问题。

后续行动：

• 若您需要进一步了解借款纠纷与投资纠纷的法律区别和诉讼策略，或需要针对具体案件提供法律意见，请直接向我咨询。我将根据您的实际情况和证据情况，为您提供专业、全面的法律服务。