在投标文件中，供应商授权代表签字或盖章处盖了法人章，其有效性需根据具体情况来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律法规层面
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，在法律上，签字、盖章或按指印具有同等效力，均可作为合同成立的依据。因此，从法律法规的角度来看，盖法人章在理论上是可以视为有效签署的。
二、招标文件要求层面
遵循招标文件规定：
- 招标文件作为投标活动的核心指导文件，对投标文件的格式、内容、签署等均有明确规定。
- 如果招标文件明确要求供应商授权代表必须亲笔签字，而仅盖了法人章，则可能不符合招标文件的要求，导致投标无效。
- 反之，如果招标文件允许或未明确禁止使用法人章进行签署，则盖法人章可能是有效的。
授权与约定：
- 如果法人已提前授权相关人员（包括使用法人章）在投标文件上签署，且该授权符合法律规定及招标文件要求，则盖法人章是有效的。
- 授权书应明确授权范围、期限及被授权人的权限，以确保签署的合法性和有效性。
三、盖章的合法性与效力
有效情况：
- 使用经过合法备案和登记的法人印章（如公司公章或法人代表个人名章），通常视为代表了法人的意志，具有法律效力。
- 盖章能防止投标文件被篡改或伪造，保障投标过程的公正性和公平性。
无效情况：
- 伪造、未经备案的印章或盖章过程存在瑕疵（如不清晰、重叠等），可能影响法律效力。
- 如果盖章行为违反了招标文件的明确规定或法律法规的强制性规定，则可能导致盖章无效。
四、实际操作建议
仔细阅读招标文件：
- 在准备投标文件前，务必仔细阅读并理解招标文件的相关要求，包括签署方式、盖章要求等。
- 如有疑问，应及时向招标方咨询或澄清，以避免因误解或疏忽而导致的投标无效。
确保盖章的规范性和严肃性：
- 使用清晰、鲜明、完整的法人印章进行签署。
- 注明盖章日期，以确保投标文件的时效性和真实性。
- 确保盖章处的内容与投标文件内容一致，避免出现矛盾或不一致的情况。
结论：投标文件中供应商授权代表签字或盖章处盖了法人章，其有效性需根据法律法规、招标文件要求以及盖章的合法性与效力来综合判断。在实际操作中，建议投标人严格遵循招标文件的要求，并确保盖章过程的规范性和严肃性。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。