医院违法行为在2年内被发现但一直未处理，6年后是否还能处罚，需分情况讨论：
从行政处罚的时效性来看：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。” 这意味着，对于一般的违法行为，如果超过两年未被发现，则不再给予行政处罚。但对于涉及公民生命健康安全且有危害后果的违法行为，时效期限延长至五年。
- 在您描述的情况中，医院的违法行为在2年内已被发现，但一直未处理。此时，关键在于判断该违法行为是否涉及公民生命健康安全且有危害后果。如果是，且从违法行为发生之日起算未超过五年，那么行政机关仍然有权进行处罚。如果已超过五年，或者该违法行为不涉及公民生命健康安全或没有危害后果，且从违法行为发生之日起算已超过两年，那么行政机关可能不再给予行政处罚。不过，由于违法行为在2年内已被发现，这在一定程度上排除了“未被发现”的情形，但具体能否处罚还需看是否超过上述规定的时效期限，且需考虑是否有其他特别规定。
从法律程序的连续性来看：
- 即使违法行为在发现后未立即处理，但只要在法律规定的时效期限内，行政机关仍有权启动处罚程序。这要求行政机关在发现违法行为后，应及时进行调查取证，并在法定时效内作出处罚决定。
- 如果行政机关在发现违法行为后，由于各种原因（如证据不足、需要进一步调查等）未能立即处理，但只要在时效期限内，且行政机关能够证明其一直在积极处理该案件，那么仍然有权进行处罚。
从实际操作的可行性来看：
- 尽管法律上可能存在处罚的依据，但在实际操作中，如果违法行为已经过去六年，且行政机关在此期间未采取任何行动，那么可能会面临证据灭失、当事人难以联系等困难。这些因素可能会影响处罚的可行性和效果。
- 此外，如果医院在此期间已经采取了补救措施，如赔偿患者损失、改进医疗流程等，那么行政机关在决定是否处罚时，也可能会考虑这些因素。
建议：
- 如果您认为医院的违法行为确实存在，且给您或他人造成了损害，您可以向相关行政机关（如卫生健康委员会）举报，并要求其进行调查处理。
- 同时，您也可以考虑通过法律途径（如提起民事诉讼）来维护自己的合法权益。
总结：医院违法行为在2年内被发现但一直未处理，6年后是否还能处罚，取决于该违法行为是否涉及公民生命健康安全且有危害后果、是否超过法律规定的时效期限以及行政机关是否能够在时效期限内完成处罚程序。如果有具体法律问题，可以直接向我咨询。