小老板拿钱跑了能否立案，需分情况讨论：

一、若构成刑事犯罪，可立案侦查

1. 诈骗罪
   若小老板以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方式骗取财物，且数额达到当地标准（通常为3000元至1万元以上，具体以当地规定为准），则可能构成诈骗罪。此时，您可向公安机关报案，公安机关将依法立案侦查。
   举例：小老板以“项目投资”为由，收取您款项后失联，且无实际项目存在，可能涉嫌诈骗。

2. 职务侵占罪
   若小老板利用职务便利，将公司财物非法占为己有，且数额较大（通常为6万元以上，具体以当地规定为准），则可能构成职务侵占罪。此时，公司或您作为利益相关方可向公安机关报案。
   举例：小老板作为公司负责人，将公司资金转入个人账户后失联，可能涉嫌职务侵占。

二、若为民事纠纷，需通过民事诉讼解决

若小老板的行为仅涉及拖欠债务（如工资、借款等），未达到刑事立案标准，则属于民事纠纷范畴。此时，公安机关通常不会立案侦查，您需通过民事诉讼途径维护权益。
具体步骤：

1. 准备证据：收集合同、欠条、转账记录、聊天记录等能证明债权债务关系的材料。
   
2. 确定管辖法院：通常为被告住所地或合同履行地法院。
   
3. 提起诉讼：向法院提交起诉状及证据材料，要求小老板履行还款义务并承担违约责任。
   
4. 申请强制执行：若判决生效后小老板仍不履行，可向法院申请强制执行，冻结其财产或限制其高消费等。

三、关键判断要点

1. 证据充分性：刑事立案需证明小老板存在非法占有目的及相应行为；民事诉讼需证明债权债务关系存在。
   
2. 金额标准：刑事立案需达到当地规定的数额标准；民事诉讼无金额限制，但诉讼成本需考虑。
   
3. 行为性质：刑事犯罪需具有欺骗性或侵占性；民事纠纷仅涉及合同履行或债务清偿。

四、建议与风险提示

1. 及时行动：发现小老板失联后，尽快收集证据并咨询律师，避免证据灭失或转移财产。
   
2. 刑事报案与民事诉讼并行：若行为可能涉嫌犯罪，可同时向公安机关报案并提起民事诉讼，双重保障权益。
   
3. 注意诉讼时效：民事诉讼的诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算，逾期可能丧失胜诉权。

总结：小老板拿钱跑了能否立案，需根据其行为性质、证据充分性及金额标准综合判断。若涉嫌刑事犯罪，可向公安机关报案；若为民事纠纷，需通过民事诉讼解决。建议您根据具体情况选择合适途径，并尽快咨询专业律师以制定方案。