员工在公司发生工伤但老板跑路了，且仲裁无法找到老板时，可以按照以下步骤处理：
及时申请工伤认定：
- 遭遇老板跑路的情况，员工应尽快向当地的劳动保障行政部门申请工伤认定。即便老板跑路，只要能够证明劳动关系和工伤事实，工伤认定依然有效。
- 申请工伤认定时，需要准备劳动关系证明（如劳动合同、工资条、考勤记录等）、医疗机构诊断证明等材料。
要求老板承担责任：
- 如果单位未缴纳工伤保险，根据法律规定，工伤所需费用应由老板承担。员工可以凭借工伤认定决定书等材料，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求老板支付医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等工伤待遇。
- 仲裁过程中，如果老板缺席，仲裁委可以依法进行缺席裁决。
申请强制执行：
- 如果仲裁裁决生效后，老板仍然不履行支付义务，员工可以向法院申请强制执行。
- 法院会查询老板的财产线索，包括银行存款、房产、车辆等，并进行查封、冻结、划拨等执行措施，以保障员工的合法权益。
追究刑事责任（如适用）：
- 如果老板存在拒不支付劳动报酬等行为，且达到一定数额标准，可能涉嫌刑事犯罪（如拒不支付劳动报酬罪）。
- 在这种情况下，员工可以向公安机关报案，追究老板的刑事责任。
额外建议：
- 收集证据：在整个过程中，员工应尽可能收集与工伤相关的证据，如劳动合同、工资条、就医记录、工友证言等。这些证据在后续的索赔环节中至关重要。
- 寻求政府或劳动保障行政部门的帮助：员工可以向劳动保障行政部门反映情况，寻求其帮助和支持。劳动保障行政部门可能会参与到调查中，帮忙寻找老板或有关其财产的线索。
- 考虑连带责任主体：如果存在违法转包、分包等情况，员工还可以要求具有用工主体资格的转包方、分包方承担连带赔偿责任。
法律背景：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，员工发生工伤后，有权享受工伤保险待遇。如果单位未缴纳工伤保险，相关费用应由单位承担。
- 根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，员工与用人单位之间发生劳动争议时，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 根据《民事诉讼法》的相关规定，仲裁裁决生效后，如果一方不履行义务，另一方可以向法院申请强制执行。
员工在遭遇工伤且老板跑路的情况下，不要慌张，应依法维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。