当您在职时发现个人劳动合同丢失，但需要仲裁劳动关系时，不必过于担心，因为劳动合同的丢失并不影响您申请劳动仲裁。以下是一份详细、清晰的解答，帮助您了解如何进行仲裁：

一、劳动合同丢失不影响仲裁申请

首先，要明确的是，劳动合同的丢失并不会成为您申请劳动仲裁的障碍。劳动仲裁委员会在审理案件时，主要关注的是双方是否存在劳动关系以及相关的权益争议事实，而不仅仅依赖于劳动合同这一单一证据。

二、收集其他证明劳动关系的证据

既然劳动合同丢失，您需要积极收集其他能够证明劳动关系的证据。这些证据包括但不限于：

1. 工资支付凭证或记录：如工资条、银行流水等，这些能够证明您从用人单位处获得了劳动报酬。
2. 社保缴纳记录：您可以到社保经办机构打印社保缴纳记录，这也能证明您与用人单位之间存在劳动关系。
3. 工作证、服务证等身份证明：用人单位向您发放的能够证明您身份的证件。
4. 考勤记录：如打卡记录、签到表等，这些能够证明您在用人单位的工作时间。
5. 同事的证人证言：如果有同事愿意为您作证，他们的证言也可以作为证明劳动关系的证据。
6. 用人单位的招工招聘记录：如您填写的“登记表”、“报名表”等招用记录。

三、准备仲裁申请书

在收集到足够的证据后，您需要准备一份仲裁申请书。在申请书中，您需要清晰写明以下内容：

1. 双方基本信息：包括您的姓名、性别、年龄、住址等，以及用人单位的名称、地址、法定代表人等。
2. 仲裁请求：明确您希望仲裁委员会裁决的事项，如支付工资、经济补偿等。
3. 事实和理由：详细阐述您与用人单位之间存在劳动关系的事实，以及您提出仲裁请求的理由。

四、提交仲裁申请

准备好仲裁申请书和相关证据材料后，您需要向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交申请。在提交申请时，请确保所有材料都是完整、清晰的，并按照仲裁委员会的要求进行装订和提交。

五、参加仲裁庭审

仲裁委员会受理后，会安排开庭审理。在庭审中，您需要按时参加，并充分陈述您的主张和证据。仲裁委员会会依据相关劳动法律法规进行审理和裁决。只要您的证据充分，能够证明劳动关系以及争议事项，您就有可能通过仲裁维护自己的合法权益。

六、注意事项

1. 仲裁时效：请注意仲裁时效的规定，确保在规定时间内提出申请。
2. 证据充分性：尽量收集全面、充分的证据来证明劳动关系和争议事项。
3. 法律咨询：如果您对仲裁流程或相关法律法规不熟悉，可以寻求专业律师的法律咨询和帮助。

总之，即使劳动合同丢失，您仍然可以通过收集其他证据来证明劳动关系，并申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。希望以上解答能够对您有所帮助。