陪产假期间，公司不应扣除员工的工资，员工的工资应按正常标准发放。以下是对此问题的详细分析：
一、陪产假的法律依据
陪产假并非全国统一规定的假期，而是由各地方法规根据当地实际情况进行具体规定。例如，《上海市人口与计划生育条例》、《河南省人口与计划生育条例》等，均明确了男性员工在妻子生育期间可享受的陪产假天数，并规定陪产假期间应视为出勤。这些条例为陪产假期间的工资权益提供了法律保障。
二、陪产假期间工资发放标准
基本工资与固定部分：
- 陪产假期间，员工的基本工资、岗位工资以及各类津贴等固定部分应全额发放，不受影响。这是基于员工在陪产假期间仍被视为出勤的事实，以及相关法律法规中用人单位不得无故克扣劳动者工资的规定。
奖金与绩效部分：
- 对于工资中包含奖金、绩效等与工作业绩挂钩的部分，由于陪产假期间员工未实际提供劳动，用人单位可能会根据单位规章制度和绩效考核办法进行调整。但这种调整应合理且符合法律法规，不能损害员工的合法权益。若调整不合理，员工有权提出异议并寻求法律援助。
生育保险的影响：
- 若用人单位依法为职工缴纳了生育保险，职工在陪产假期间的工资（或生育津贴）一般按照当地生育保险政策规定的标准，由生育保险基金支付。若职工工资高于社会平均工资标准，则由用人单位补足差额。这确保了员工在陪产假期间能够获得与正常出勤相当的工资待遇。
三、用人单位的责任与义务
遵守法律法规：
- 用人单位应严格遵守国家及地方关于陪产假的法律法规，确保员工在陪产假期间的合法权益得到充分保障。这包括按时足额支付工资、不克扣或拖欠工资等。
支持配合申请：
- 在员工提出陪产假申请时，用人单位应给予积极支持和配合，及时审批并安排相关假期。这有助于员工更好地履行家庭责任，同时也有助于维护员工的身心健康和工作积极性。
应对违法行为：
- 若用人单位违反法律法规，克扣或拖欠员工陪产假期间的工资，员工有权向劳动行政部门投诉，并可通过协商、劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自己的合法权益。这为员工提供了有效的法律救济途径。
四、特殊情况处理
- 用人单位未依法支付工资：
- 若用人单位违反规定扣发或未按规定支付陪产假期间工资，员工除了可以通过上述法律途径维权外，还可以要求用人单位支付相应的经济补偿或赔偿金。这有助于进一步保障员工的合法权益。
总结：陪产假期间，员工的工资不会被扣除，且应按照正常出勤的工资标准发放。员工应了解当地的具体规定，以确保自身权益得到充分保障。同时，用人单位也应履行法定义务，确保员工陪产假期间的合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。