结论前置：连续旷工两天扣除半个月工资的做法，在大多数情况下是不合法的。
法律依据与分析
工资支付的基本原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有法定或约定的合理理由，否则用人单位不得随意扣除劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也明确规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这进一步强调了工资支付的及时性和足额性。
旷工当天的工资处理：
- 员工旷工当天，由于未提供劳动，用人单位有权不支付当天的工资。这是合理的，因为劳动者没有履行其基本的劳动义务。
经济损失的赔偿：
- 若员工旷工给用人单位造成了实际经济损失，根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可以要求员工赔偿。但赔偿金额需从员工工资中扣除，且每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。这一规定限制了用人单位扣除工资的幅度，保护了劳动者的基本生活需求。
扣工资的合法性：
- 用人单位不能随意以旷工为由扣除员工工资作为惩罚。除非员工旷工确实给单位造成了经济损失，并且赔偿金额在法定范围内，否则扣除工资的行为构成违法。连续旷工两天扣除半个月工资，显然超出了法定赔偿范围，因此是不合法的。
规章制度的制定与执行：
- 用人单位应当在规章制度中明确旷工的定义、违纪级别及对应的处罚措施，并通过民主程序制定且向劳动者公示或告知，该规章制度才对劳动者具有法律效力。如果用人单位缺乏合法有效的规章制度作为依据，随意扣工资是缺乏合理性和合法性基础的。
争议解决途径
沟通协商：
- 劳动者首先应与用人单位进行沟通协商，说明法律规定和自身情况，要求单位纠正错误的扣工资行为，并补发被多扣的工资。这是解决争议的最直接和有效的方式。
劳动监察投诉：
- 若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的工资支付情况进行监督检查，并责令用人单位改正违法行为。这可以为劳动者提供一种官方和有力的维权途径。
劳动仲裁与诉讼：
- 劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径要求单位支付被克扣的工资，并根据具体情况主张相应的赔偿。如果仲裁申请未得到受理，或对裁决结果有异议，劳动者有权向法院提起诉讼。这是解决劳动争议的最终法律手段。
典型案例参考
- 实践中，曾有用人单位因员工旷工而扣除大量工资，最终员工通过劳动仲裁和法院诉讼成功维权。这些案例表明，用人单位在处理员工旷工问题时，必须严格遵守法律法规，不能随意扩大处罚力度，否则将承担法律责任。
总结与建议：
连续旷工两天扣除半个月工资的做法在大多数情况下是不合法的。用人单位应依法处理员工旷工问题，确保员工的合法权益不受侵害。同时，劳动者也应了解自身权益，遇到不合法的扣工资行为时，积极采取法律手段维护自己的合法权益。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。