造成公司损失后，员工赔偿是合法的，但公司对员工进行罚款则不合法。以下是对这一问题的详细分析：
一、员工赔偿的合法性
法律依据：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
赔偿范围与条件：
- 赔偿范围通常限于与工作相关的实际损失，如设备损坏维修费、产品报废损失等直接损失。
- 赔偿条件包括员工存在故意或重大过失行为，且该行为与损失之间存在直接因果关系。
- 赔偿金额需合理，不得超过员工实际造成的损失，且扣除工资后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
二、公司罚款的非法性
法律禁止：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，企业并不具备行政处罚权，因此无权对员工进行罚款。罚款作为一种行政处罚手段，只能由法定的国家机关行使。
保护员工权益：
- 随意罚款会损害员工获得劳动报酬的权利，违反劳动法的基本原则，即保障劳动者的合法权益不受侵犯。
三、公司合法处理员工造成损失的方式
要求员工赔偿：
- 如前所述，公司可以依据劳动合同或规章制度要求员工赔偿因故意或重大过失造成的损失。
- 赔偿方式可以是一次性支付或分期扣款，但需确保扣除工资后剩余工资不低于当地最低工资标准。
通过合法途径追责：
- 公司可以收集证据，如监控录像、工作记录、第三方鉴定报告等，证明损失与员工行为的因果关系及具体金额。
- 协商不成时，公司可以申请劳动仲裁或提起诉讼，要求员工承担赔偿责任。
完善内部管理制度：
- 公司可以制定合法有效的规章制度，明确员工的行为规范和违规后果。
- 规章制度需经过民主公示程序，确保员工知晓并同意。
- 规章制度中的处罚措施需合理，不得违反法律法规的强制性规定。
四、员工权益保护与救济途径
沟通协商：
- 如果员工认为公司的赔偿要求不合理或罚款行为不合法，首先应与公司进行沟通协商，要求公司说明依据和理由。
投诉与仲裁：
- 若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 劳动保障行政部门会责令用人单位限期支付克扣的工资或赔偿金，若限期不支付，还会加付赔偿金。
建议：作为员工，在面对公司要求赔偿或罚款时，应首先了解自己的合法权益和法律规定。如果认为公司的要求不合理或违法，应及时与公司沟通协商或寻求法律救济。作为公司，在处理员工造成损失的问题时，应依法依规进行，避免因违法罚款而引发劳动纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。