合作机构注销后，是否构成解除合作关系的违约，需视具体情况而定，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
一、合同条款的约定
若合同中有明确约定：
- 如果合作合同中明确规定了合作机构注销时的处理方式，比如注销后合同自动终止或需要双方协商解除等，那么应按照合同条款执行。
- 若合同条款中明确指出，合作机构注销即视为违约，并约定了相应的违约责任，那么注销方需承担违约责任。
若合同中无明确约定：
- 当合同中没有对合作机构注销的情况作出明确规定时，需要依据相关法律法规和合同法的原则进行判断。
二、法律法规的适用
根据《民法典》的相关规定：
- 合同的解除应当遵循法定或约定的程序。若合作机构注销导致合同无法继续履行，且双方未就解除事宜达成一致，可能涉及违约问题。
- 但若注销是由于不可抗力（如自然灾害、政策调整等）或对方同意的原因导致，且注销方及时通知了对方并采取了合理措施减少损失，那么可能不构成违约。
考虑合同的实际履行情况：
- 如果合作机构注销前，双方已经按照合同约定履行了大部分义务，且注销不影响已履行部分的效力，那么注销可能不构成对整体合同的违约。
- 但若注销导致合同目的无法实现，且注销方未采取合理措施补救，那么可能构成违约。
三、实际案例与司法实践
- 在司法实践中，法院会综合考虑合同条款、法律法规、合同履行情况以及双方当事人的过错程度等因素，来判断合作机构注销是否构成违约。
- 例如，如果注销是由于合作机构自身经营不善导致，且注销方未提前通知对方或未采取合理措施减少损失，那么法院可能会认定注销方构成违约。
四、建议与措施
审查合同条款：
- 在签订合作合同时，应明确约定合作机构注销时的处理方式，包括合同是否继续履行、如何解除、违约责任等。
及时沟通协商：
- 若合作机构面临注销的情况，应及时与对方沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。
保留证据：
- 在合作过程中，应保留好相关证据，如合同、履行记录、沟通记录等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
总结来说，合作机构注销后是否构成解除合作关系的违约，需根据合同条款、法律法规以及实际履行情况等因素进行综合判断。如果有具体的合同条款或实际情况需要分析，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。