结论前置：在工程未经验收的情况下，甲方擅自投入使用，将面临多方面的法律后果，包括但不限于丧失对部分质量问题主张权利的资格、可能承担违约责任及安全隐患引发的法律责任。因此，建议各方严格遵守合同约定，确保工程按程序验收后再投入使用。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律规定与责任界定
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第十四条，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用后，又以使用部分质量不符合约定为由主张权利的，人民法院不予支持；但是承包人应当在建设工程的合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量承担民事责任。
工程质量责任：
- 一般质量问题：甲方擅自使用后，对于非地基基础工程和主体结构的一般质量问题，如装修瑕疵、设备故障等，法院通常不支持其后续的质量主张，风险由甲方自行承担。
- 地基基础和主体结构：即使甲方擅自使用，乙方仍需在工程合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构的质量问题承担责任，这是为了确保建筑物的基本安全。
竣工日期认定与法律后果：
- 未经竣工验收而擅自使用的，以转移占有建设工程之日为竣工日期。这将影响工程款支付时间、质量保修期限等后续事宜，可能导致甲方需提前支付工程款或缩短质量保修期。
二、合同违约与安全隐患
合同违约：
- 甲方擅自使用工程违反了合同中关于验收程序的约定，构成违约。根据合同约定，甲方可能需要承担相应的违约责任，包括但不限于赔偿乙方因此遭受的损失，如乙方因甲方擅自使用而导致的额外费用或损失。
安全隐患与法律责任：
- 未经验收的工程可能存在未知的质量缺陷或安全隐患。使用过程中若发生事故，如建筑物倒塌、设备故障等，甲方作为实际使用者可能需承担法律责任和赔偿责任。这不仅可能给甲方带来经济损失，还可能影响其声誉和信誉。
三、应对措施与建议
乙方的应对：
- 固定证据：发现甲方擅自使用时，乙方应及时通过拍照、录像等方式固定证据，为后续可能的纠纷做准备。
- 沟通协商：积极与甲方沟通，要求其停止擅自使用，并协商解决工程验收、交付等问题。通过友好协商，可能达成双方都能接受的解决方案。
- 法律维权：若甲方因擅自使用引发纠纷，如拒付工程款或主张质量问题，乙方可依法提起诉讼，要求支付工程款并主张违约责任。在诉讼过程中，乙方应提供充分的证据支持其主张。
对甲方的建议：
- 严格遵守合同约定：按照合同约定的程序和标准进行工程验收，确保工程质量和安全。这是避免法律纠纷和风险的基本前提。
- 特殊情况处理：若确需提前使用工程，应与乙方协商并达成书面协议，明确双方权利义务，降低法律风险。书面协议应详细规定提前使用的条件、期限、责任承担等事项。
总结与建议：工程未经验收而擅自使用将带来多重法律后果和安全隐患。各方应严格遵守合同约定，确保工程按程序验收合格后再投入使用。若遇到特殊情况需提前使用，应与对方协商并达成书面协议，以明确双方权利义务并降低法律风险。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。