首先，我们来计算每天的违约金数额：
合同总金额为40万，违约金为每天千分之一，那么每天的违约金计算方式为：
\(违约金 = 合同总金额 \times 违约金比例\)
\(违约金 = 400000 \times 0.001 = 400元\)
所以，每天的违约金是400元。
接下来，我们分析违约金的合理性：
法律原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。这意味着违约金的数额和计算方式首先由合同双方自行约定。
合理性判断：
- 违约金应当与违约行为造成的损失相称，不得过高或过低。如果约定的违约金过分高于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
- 在实践中，判断违约金是否过高的一个重要标准是看是否超出造成损失的百分之三十。如果违约金金额超出了实际损失的30%，那么此部分费用可能会被人民法院拒绝予以认可。
具体建议：
- 对于您的情况，每天千分之一的违约金（即每天400元）在法律上是允许的，但具体是否合理还需结合实际损失来判断。
- 如果对方认为违约金过高，并提出了减少违约金的请求，法院可能会根据实际损失情况来调整违约金的数额。
- 因此，建议您在设定违约金时，尽量使其与可能因违约造成的损失相匹配，以避免后续的法律纠纷。
总结：
- 每天的违约金是400元。
- 违约金的合理性取决于其是否与违约行为造成的损失相称。如果约定的违约金不过分高于实际损失，那么它是合理的；如果过分高于实际损失，则可能会被法院调整。
如果您在合同纠纷方面有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。