当合同作废并签订了新的合同作废协议后，原合同的处理方式需要遵循一定的法律程序和商业惯例，以确保双方的权益得到妥善保护。以下是关于原合同处理方式的详细解答：

一、明确作废共识与时间

首先，买卖双方（或合同双方）必须就撤销原合同及具体时间达成明确的共识。这一共识可以通过出具正式的文字说明，或者在新签订的合同作废协议中明确体现。这样做是为了确保双方对原合同的作废有清晰、一致的认识，避免后续产生纠纷。

二、清算已履行内容

对于原合同中已经履行完毕的部分，双方需要根据实际情况进行精确且妥善的清算。这包括但不限于：

• 已交付的商品：如果商品已经交付，双方需要商讨是否需要进行退货、换货或保留商品等操作。
• 已收取的款项：如果款项已经收取，双方需要商讨是否需要进行退款、调整款项或保留款项等操作。

清算过程中，双方应保持沟通，确保清算结果公平、合理。

三、处理第三方权益与责任

如果原合同中涉及到了第三方的权益和责任，那么在修订和重新签订合同的过程中，必须充分考虑并妥善处理这些影响。这可能需要与第三方进行协商，确保第三方的权益不受损害，同时明确各方在新合同中的责任和义务。

四、书面资料归档与保管

宣布原合同失效所涉及的书面资料，包括原合同、合同作废协议、清算记录等，都需要进行归档并妥善保管。这些资料在未来可能发生的法律争端中，将作为重要的证据支持。因此，双方应确保这些资料的完整性、真实性和可追溯性。

五、法律后果与责任界定

• 原合同权利义务关系消灭：合同作废后，原合同所设定的双方权利和义务不再具有法律拘束力。
• 已履行部分的处理：对于原合同中已履行的部分，双方可根据协商一致的结果进行维持现状、清算或返还等操作。
• 损失赔偿责任：如果因原合同作废给一方造成损失，有过错的一方可能需要承担赔偿责任。如果双方都有过错，则各自承担相应责任。

六、特定条款的效力

值得注意的是，即使合同作废，原合同中的一些特定条款（如保密条款、争议解决条款等）在一定情况下可能依然有效。因此，在处理原合同时，双方需要仔细审查这些条款，并明确其在新合同中的适用性和效力。

综上所述，当合同作废并签订了新的合同作废协议后，原合同的处理方式需要综合考虑多个方面。通过明确作废共识与时间、清算已履行内容、处理第三方权益与责任、书面资料归档与保管以及了解法律后果与责任界定等措施，可以确保原合同得到妥善处理，同时保护双方的合法权益。