当股东经多次通知仍拒不参加股东会时，公司需要采取一系列合法且合理的措施来确保会议的顺利进行以及决策的合法性，同时也要尊重和保护股东的合法权益。以下是对此问题的详细解答：
一、确认通知程序的有效性
首先，公司应确保已按照《公司法》及公司章程的规定，以正确的时间和方式向拒绝参会的股东发出了会议通知。通知中应明确会议的时间、地点、议题等关键信息。如果通知程序存在瑕疵，股东有权提出异议，这可能会影响决议的有效性。因此，完善的通知程序是确保会议合法性的基础。
二、区分决议事项及股权比例
一般事项：对于普通决议事项，如公司的日常经营决策等，通常只需代表一定比例以上表决权的股东出席并通过即可。例如，在有限责任公司中，一般决议需经代表二分之一以上表决权的股东通过。如果拒绝参会股东的表决权不影响这一比例，会议可以正常召开。
特殊事项：对于修改公司章程、增减注册资本、公司合并、分立、解散或变更形式等特殊决议事项，法律要求更高，通常需经代表三分之二以上表决权的股东通过。如果拒绝参会股东的表决权可能影响这一比例，公司需要与其沟通，了解其拒绝参会的原因，并尽量争取其配合。
三、记录缺席情况与沟通解决
在股东会会议记录中，应明确记载缺席股东的姓名、持股比例及未出席原因（如已知）。同时，公司应分析股东拒绝参会的原因，可能是利益诉求未得到满足、时间冲突或其他客观原因。公司应与股东进行沟通，了解其具体诉求，并在合法合规的前提下协商解决方案。
四、处理恶意不参会的情况
如果股东出于不正当目的恶意拒绝参加股东会，阻碍公司正常决策和运营，且有充分证据证明，公司可以通过法律途径维护自身权益。例如，依据公司章程限制该股东的相关权利，或通过诉讼要求其履行股东义务。
五、按照章程进行表决与记录异议
即使部分股东未出席，只要出席股东的表决权达到法定要求，会议仍可以正常进行并表决。表决结果应按实际出席并投票的股东意见统计和记录。对于因故未能出席但对会议议题有异议的股东，应确保其异议被记录和考虑，并可通过书面形式提交异议意见。
六、遵循公司治理原则
在处理股东拒绝参加股东会的问题时，公司应遵循公平、公正、透明和效率等公司治理基本原则。确保所有股东权益得到平等对待，避免任何形式的歧视或不公平待遇。
七、决议的后续处理
依法定程序作出的有效决议对拒绝参会股东同样具有约束力。如果该股东不执行决议，公司可以通过协商、催告等方式要求其履行义务；如果仍拒不履行，公司可根据具体情况通过法律途径追究责任。
综上所述，当股东经多次通知仍拒不参加股东会时，公司应综合考虑通知程序的有效性、决议事项的性质和股权比例、与股东的沟通情况等多个方面，确保会议的顺利进行及决策的合法性，同时尊重和保护股东的合法权益。