厂区围墙被邻居在上面建房，这一行为通常是违法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、从物权法角度（虽原物权法已废止，但相关原则在民法典中得以延续）
所有权保护：
- 厂区围墙作为工厂的不动产组成部分，其所有权归工厂所有。邻居未经工厂同意，在围墙上建房，侵犯了工厂的所有权。
- 根据《民法典》中关于物权保护的规定，所有权人有权要求侵占人停止侵害、排除妨碍、恢复原状等。
相邻关系：
- 相邻关系是指不动产的相邻各方在行使所有权或使用权时，因相互间依法应当给予方便或接受限制而发生的权利义务关系。
- 邻居在厂区围墙上建房，可能违反了相邻关系中的“不得妨碍他人正常使用不动产”的原则。
二、从城乡规划法角度
规划许可：
- 在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物建设的，应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。
- 邻居未经规划许可，在厂区围墙上建房，属于违法建设行为。
违法建设后果：
- 违法建设可能面临被责令停止建设、限期拆除、罚款等行政处罚。
- 若违法建设影响城市规划，且无法采取改正措施消除影响的，可能面临强制拆除。
三、从实际影响角度
安全隐患：
- 在围墙上建房可能改变围墙的结构和稳定性，存在安全隐患。
- 若因此导致围墙倒塌等事故，邻居可能承担相应的法律责任。
纠纷解决：
- 工厂与邻居之间因此产生纠纷的，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。
- 在解决纠纷过程中，工厂可以主张自己的合法权益，要求邻居停止侵害、恢复原状或赔偿损失等。
法律建议
收集证据：
- 工厂应收集邻居在围墙上建房的相关证据，如照片、视频、证人证言等。
与邻居协商：
- 工厂可以尝试与邻居协商，要求其停止建房行为并恢复原状。
向相关部门投诉：
- 若协商无果，工厂可以向当地城乡规划部门、城市管理部门等投诉，要求其依法处理。
寻求法律救济：
- 若邻居的行为给工厂造成损失的，工厂可以依法向人民法院提起诉讼，要求邻居承担赔偿责任。
综上所述，厂区围墙被邻居在上面建房是违法的。工厂应依法维护自己的合法权益，通过协商、投诉或诉讼等方式解决纠纷。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。